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Mesures de chlorophylle-a par spectrographie et bentotorch basés sur les biofilms photosynthétiques - Observatoire Sélune

Les communautés microbiennes jouent un rôle majeur dans le fonctionnement des écosystèmes : elles sont à la base de la chaîne alimentaire (production primaire) et participent à la dégradation de la matière organique. Ces communautés sont, de plus, connues pour répondre rapidement à des changements environnementaux. Elles peuvent être utilisées comme indicateurs écologiques, à l'instar des macro-invertébrés.

Les diatomées benthiques sont les organismes photosynthétiques majoritaires au sein de cette communauté biologique. L’abondance relative des différentes espèces permet de calculer un indice de qualité du milieu (IBD). Des fortes différences de communautés entre les zones amont et aval ont été constatés quand les barrages étant en place. Elles seront amenées à évoluer après l’effacement de ces barrages.

Dans le cadre de l'observatoire Sélune ont été disposées des stations pilotes le long du cours principal de la Sélune, réparties de l’amont à l’aval des barrages hydroélectriques. Trois stations se situent dans les anciennes retenues des barrages, les deux autres, dites de référence, sont hors zone d'influence des anciens barrages (l'une étant en aval et l'autre en amont). Dans ces stations, les biocénoses aquatiques (incluant macroinvertébrés benthiques, biofilms, macrophytes...) sont suivies. Depuis septembre 2014, les stations sont idéalement échantillonnées tous les mois d’Avril à Octobre (7 relevés annuels) à l'aide de substrats artificiels (lames de verre disposées dans l'eau). En plus du relevé des diatomées (liste floristique, calcul de l'IBD), la concentration en chlorophylle-a est mesurée.


Lors de chaque campagne, un protocole d'échantillonnage expérimental INRAe est mis en oeuvre. Ce protocole implique des dispositifs d'immersion (1 mois) de lames de verre, une mesure in situ de concentration en chlorophylle-a via BentoTorch puis une récolte du biofilm sur ces lames de verre. Le biofilm est conditionné dans (1) dans de l'éthanol à 99.9% pour la détermination des IBDs et des listes floristiques (prestation externalisée, s'appuyant sur la norme NF T90-354) et (2) dans de l'eau minérale pour mesure de concentration de la chlorophylle-a via spectromètre.


NB : l'année 2023 n'est pas couverte en matière de mesure de concentration en chlorophylle-a via Spectrométrie suite à un problème de conservation basse température des échantillons.


Ce jeu de données propose les mesures de concentration moyenne journalière de chlorophylle-a et de phéopigment en µg/cm2/jour

Simple

Date (Création)
2025-03-05T16:00:00
Edition

2025

Identificateur
fr-20250303103810-umrsas-selune-v_bioc_biofilm_chloro_bt_spectro_biofilm
But

Cette couche donne les résultats obtenus pour les mesures de chlorophylle-a (bentoTorch et spectrmétrie) ainsi que phéopigment

Etat
Mise à jour continue
Point de contact
  INRAE DECOD - Jean-Marc Roussel ( )
65 rue de Saint-Brieuc - CS 84215 , Rennes , 35042 , France
+33 2 23 48 57 86
Point de contact
  INRAE DECOD - Gorzérino Caroline ( )
funder
  AESN - ( )
1, rue de la Pompe - BP 70087 , HEROUVILLE SAINT-CLAIR Cedex , 14203 , France
02 31 46 20 20
Point de contact
  Université de Rennes - Pannard Alexandrine
Gestionnaire
  INRAE U3E - Nadine Herrard
Fréquence de mise à jour
Lorsque nécessaire
Remarque sur la mise à jour

Dernière mise à jour : 05/03/2024 avec les données de l'automne 2024

Thème
  • Données ouvertes

Thème
  • Limite

Thèmes INSPIRE

  • Installations de suivi environnemental

  • Environnement

GEMET

  • biologie

  • environnement

  • faune

Limitation d'utilisation

Usage libre sous réserve des mentions obligatoires sur tout document de diffusion : "Source : INRAE - U3E"

Limitation d'utilisation

Licence ouverte : https://www.etalab.gouv.fr/licence-ouverte-open-licence

Contraintes d'accès
Autres restrictions
Contraintes d'utilisation
Licence
Autres contraintes

Pas de restriction d’accès public

Type de représentation spatiale
Vecteur
Dénominateur de l'échelle
25000
Langue

fre

Catégorie ISO
  • Environnement
  • Localisation
N
S
E
W


Date de début
2014-01-01
Date de fin
2027-12-31
Nom du système de référence
RGF93 / Lambert-93 (EPSG:2154)
Type de géométries des objets
Point

Distributeur

Distributeur
  UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest - Pole GéoSAS
65 rue de Saint-Brieuc , Rennes cedex , 35042 , France
Nom

ESRI Shapefile

Version

1.0

Ressource en ligne
Observatoire Sélune ( WWW:LINK-1.0-http--link )
Ressource en ligne
v_bioc_biofilm_chloro_bt_spectro_biofilm ( OGC:WMS )

Mesures de chlorophylle-a par spectrographie et bentotorch basés sur les biofilms photosynthétiques - Observatoire Sélune

Ressource en ligne
selune:v_bioc_biofilm_chloro_bt_spectro_biofilm ( OGC:WFS )

Mesures de chlorophylle-a par spectrographie et bentotorch basés sur les biofilms photosynthétiques - Observatoire Sélune

Ressource en ligne
Télécharger "Mesures de chlorophylle-a par spectrographie et bentotorch basés sur les biofilms photosynthétiques - Observatoire Sélune" au format JSON ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
Ressource en ligne
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Ressource en ligne
Télécharger "Mesures de chlorophylle-a par spectrographie et bentotorch basés sur les biofilms photosynthétiques - Observatoire Sélune" au format shapefile ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
Niveau
Jeu de données

Résultat de conformité

Date (Publication)
2013-12-10
Explication

Non Evalué

Degré de conformité
Non
Généralités sur la provenance

Listes floristiques et abondances obtenues suivant la norme NF T90-354 (Novembre 2021).


La liste des champs présentés dans ce jeu de données est précisé dans le catalogue associé.

Référence du catalogue d'objet
  • a42a0202-717f-4f7f-aa63-a5841f8e366b
Identifiant de la fiche
991305b9-43bb-4acc-ae31-03e8ed147eb7 XML
Langue

fre

Jeu de caractères
Utf8
Identifiant de la fiche de métadonnées parent
Programme scientifique Sélune

32b2d23e-0f67-46fb-ad72-110514f1c8ee

Type de ressource
Jeu de données
Date des métadonnées
2025-03-26T16:19:30
Nom du standard de métadonnées

ISO 19115

Version du standard de métadonnées

1.0

Point de contact
  UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest - GéoSAS ( )
65 rue de Saint-Brieuc - CS 84215 , Rennes , France , 35042 , France
00 33 (0)2 98 95 99 68
http://geowww.agrocampus-ouest.fr
 
 

Aperçus

Étendue spatiale

N
S
E
W


Mots clés

Données ouvertes Limite
GEMET
biologie environnement faune
Thèmes INSPIRE
Environnement Installations de suivi environnemental

Fourni par

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Ressources associées

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