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ECOBIO UMR 6553 CNRS Université de Rennes

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    This dataset includes data related to the cold tolerance as well as the physiological readjustments in response to different gradual and developmental acclimation of females D. suzukii. In each acclimation type, experiments were conducted in the lab and the ecological relevance was verified with experiments in the field. This dataset provides critical thermal minimum, chill coma recovery time and acute stress survival data, in addition to metabolomic data performed on GC-MS and GC-HRMS.

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    Projet Fleur 2015-2018 : données décembre 2015- mars 2018 Echantillonnage de raveurs et de leurs ennemis naturels dans les champs de céréales et deux types d'habitats adjacents, marges herbeuses et bandes fleuries semées. Echantillonnage en période hivernale de Décembre à mi-Mars. Les organismes ont été échantillonnés par piège barbers, placés dans la culture proche des habitats adjacents et au sein de ces derniers

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    Objectifs : 1. Etude de la dynamique de diffusion des pesticides dans les bandes enherbées selon un gradient de distance parcelle agricole-cours d’eau. 2. Etude de la dynamique de croissance et de l’état physiologique du couvert végétal des bandes enherbées. 3. Etude du potentiel de rétention/dégradation des pesticides du compartiment végétal des bandes enherbées. Démarches : Enquête auprès des agriculteurs de la ZAA pour connaitre les pesticides et doses épandus de 2010 à 2012 ; Echantillonnage de sol, d’eau du sol et de végétation à différents endroits des bandes enherbées, et à 10m de la bande au sein de la parcelle (sol uniquement), pour effectuer des analyses de pesticides ; Caractérisation du couvert végétal des bandes enherbées (recouvrement spécifique, biomasse aérienne, mesure des niveaux de chlorophylles). Caractérisation des réponses métaboliques d’espèces clés du couvert végétal selon le gradient parcelle-cours d’eau. Articles de références : A compléter par la suite (refs analyses pesticides, etc.) Programmes de recherche/financements : i. Projet « Phytobandes : Rôle(s) biologique(s) du compartiment végétal sur la dynamique des pesticides et des nitrates dans un contexte de bandes enherbées en environnement agricole » financé par le programme inter-organisme IngECOTech CNRS/CEMAGREF ; ii. Projet « ToPoBiov : Tolérance aux polluants au sein de la biodiversité végétale de sites contaminés », financé par la Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité (FRB) ; iii. Bourse de thèse de la région Bretagne (2011-2014) iv. 2 financements OSUR (2012, 2015) v. Financement ECOBIO axe Ecologie des stress (2014)

  • Mesures piézométriques: carte des emplacements (couche SIG) et relevés (archive au format .csv)

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    Le jeu de données comprend la vitesse de décomposition en milieux aquatique, terrestre humide et terrestre sec dans la forêt de Villecartier pour 18 espèces d'arbres (..........................................). Les caractéristiques chimiques (composition élémentaire C,N,P; teneur en phénol/polyphénol, cellulose, hémicellulose, métaboliques secondaires, terpènes, micronutriments) ainsi que leurs caractéristiques physiques (dureté, épaisseur, SLA, capacités de retention en eau) ont également été mesurées. De plus, la colonisation par les invertébrés et la biomasse microbienne (par mesure de respiration par la méthode SIR) ont été mesurées dans chaque milieux et pour chaque type de feuille. Des données sur les communautés d'invertébrés et les conditions climatiques (température, hygrométrie) des sites sont également disponibles

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    Occupation du sol des parcelles observées dans le cadre du projet PLANTSERV, 2019-2021

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    Title: Necrosis is a major driver of thermal stress-induced mortality in Drosophila melanogaster larvae: cellular and molecular insights across acclimation phenotypes Authors: Fatemeh Saeidi & Hervé Colinet Affiliation: Université de Rennes, CNRS, ECOBIO (Ecosystèmes, biodiversité, évolution) – UMR 6553, 35000 Rennes, France This repository contains raw data files (in .txt format) associated with the study investigating cell death dynamics induced by cold (-3°C) and heat (38°C) stress in third-instar Drosophila melanogaster larvae. The study compared three acclimation phenotypes: - LNA: Non-acclimated larvae (reared at 25°C for 4 days) - LCA: Cold-acclimated larvae (reared at 15°C for 10 days) - LHA: Heat-acclimated larvae (reared at 30°C for 3 days) All data files are in tab-delimited text format (.txt). For detailed statistical methods, please refer to the Materials & Methods section of the associated manuscript. LNA : Non-acclimated larvae (reared at 25°C for 4 days) LCA : Cold-acclimated larvae (reared at 15°C for 10 days) LHA : Heat-acclimated larvae (reared at 30°C for 3 days) BS : Black spots (melanized lesions) NBS : No black spots Co : Unstressed control CTCF : Corrected total cell fluorescence ROS : Reactive oxygen species GLM : Generalized linear model GLMM : Generalized linear mixed model PCA : Principal component analysis RpL32 : Reference gene used for normalization

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    Projet Fleur 2015-2018 : données décembre 2015- mars 2018 Echantillonnage de pucerons et de leurs ennemis naturels dans les champs de céréales et deux types d'habitats adjacents, marges herbeuses et bandes fleuries semées. Echantillonnage en période hivernale de Décembre à Mars. échantillonnage de carabes, araignées et staphylins dans les parties de culture proche de chaque habitat adjacent et au sein de ces derniers. Les prédateurs du sol ont été échantillonnés par piège barber dans tous les habitats.

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    Tests de repasse sur différents individus de différentes espèces de passereaux, en milieu urbain. Le temps de réponse est enregistré et plusieurs tests sont réalisés sur chaque individu. Zones de corridor et de matrice urbaine testées. Détails dans : Balbi, M. (2017). Validation de la fonctionnalité des continuités écologiques en milieu urbain : approches plurispécifiques et multi-sites. Thèse de doctorat en Biologie, Rennes 1. http://www.theses.fr/2017REN1B034  

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    Projet Fleur 2015-2018 : données décembre 2015- mars 2018 Echantillonnage de ravageurs et de leurs ennemis naturels dans les champs de céréales et deux types d'habitats adjacents, marges herbeuses et bandes fleuries semées. Echantillonnage en période hivernale de Décembre à mi-Mars. Les limaces ont été échantillonnées dans les parties de culture proche des habita.ts adjacents et au sein de ces derniers. L'échantillonnage a été réalisé par pièges barbers