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This dataset is linked to the manuscript “A recipe for a good π. How to properly estimate population genetics summary statistics and why we should systematically report them.” It gathers all data, metadata, and scripts necessary to generate the figures. To redo analyses and figures, one can download the whole directory and follow the README.md plus Jupyter notebooks detailing the whole pipeline (2026-01-23)
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!! A mettre à jour !! (Accès jeu de données) "Relevés de flore en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la flore au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - Dix quadrats de 50 * 50 cm, positionnés tous les 3 mètres sur une bande située à 50m de la bordure de la parcelle (cf. schéma ci-dessous). Pour chacun noter : - le % de recouvrement pour : adventices total, graminées, dicotylédones, espèce dominante, espèces en montaison (attention graminées, fleurs discrètes) - le nombre d’espèces total, graminées, dicotylédones. Ces suivis ont été effectués en 2014, 2015, 2018, 2021 et 2023 Programmes de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; projet PREPARE; projet STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/
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Emprise de la carte pédologique de la Forêt de la Bourdonnaie au 1/5000. La donnée de base, au format image scannée, n'est pas publiée.
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Image satellite SPOT acquise dans le cadre du dispositif KALIDEOS Bretagne Acquisition le 09/05/2017 Le produit est protégé par des droits de diffusion. Il est disponible et téléchargeable sur le site suivant: https://bretagne.kalideos.fr/drupal/fr/mapshup_page Il est nécessaire de s'inscrire et avoir un compte pour télécharger les données KALIDEOS et il suffit de décrire son besoin (visualisation de données satellites récentes pour des applications en écologie par ex).
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"Relevés floristiques sur les 3 mini-réseaux (A, B et C) de la Zone Atelier de Pleine-fougères suivant un référentiel de 42 espèces" Relevés en présence/absence de 42 espèces floristiques (espèces du référentiel Ecobordure) dans les bords de champs des 3 mini-réseaux bocagers de Pleine-fougères Protocole: transect de 25m placé au niveau d'un tronçon homogène du bord de champ
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Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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Projet Fleur 2015-2018 : données Décembre 2015 - Mars 2018 Echantillonnage de pucerons et de leurs ennemis naturels dans les champs de céréales et deux types d'habitats adjacents, marges herbeuses et bandes fleuries semées. Echantillonnage en période hivernale de Décembre à mi-Mars. Dans la culture : échantillonnage de pucerons parasités et non-parasités par relevé exhaustif de surface de 15m² proche bandes herbeuses et proche bandes fleuries. Dans la bande fleurie les pucerons ont été échantillonnés par relevé sur 5 plants par espèce de fleurs.
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Le site de Plœmeur (Morbihan) correspond à un aquifère exploité depuis 1991 en domaine cristallin fracturé, qui fournit ~ 1 million de m3 par an pour l’alimentation en eau potable d’une ville de 20000 habitants. La qualité chimique de l’eau extraite est très bonne, elle est notamment caractérisée par un faible taux de nitrates dans une région pourtant fortement touchée par les pollutions diffuses. Bien que les roches présentes soient constituées de granites et de micaschistes, roches classiquement considérées comme peu perméables, on observe des écoulements très rapides, localisés dans quelques zones fracturées. Les problèmes essentiels concernent la vulnérabilité de l’aquifère vis à vis des transferts de polluants anthropiques, les risques éventuels de salinisation de cet aquifère côtier, et la définition des zones de recharge en lien avec la mise en place d’un périmètre de protection. Ce site dispose d’une couverture piézométrique très dense avec une cinquantaine de forages de 30 à 150 m de profondeur. Ce dispositif permet de réaliser des suivis long terme – hydrologiques, hydrochimiques et géophysiques – et des expérimentations innovantes sur les propriétés hydrologiques des milieux hétérogènes.
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Au cœur du massif karstique de la Fontaine de Vaucluse, le LSBB permet d’accéder à des échelles d’étude habituellement inaccessibles qui vont de la fracture avec son écoulement (61 à ce jour) à un continuum de 14 000 m2 (sous 30 à 519 m de couverture), avec tous les intermédiaires, notamment un bloc de 5 m de coté et 20 m de haut (5 forages). Il est donc possible d’y étudier les problèmes de changement d’échelles avec de réelles possibilités de validation. Le projet a pour finalité d’aboutir à une modélisation numérique (prenant en compte les différentes échelles spatiales et temporelles mises en jeu par le système) de sa structure complexe, des flux associés et d’élaborer les méthodologies nécessaires pour la caractérisation du milieu et à la mise en œuvre des outils de modélisation.
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Ceci est un jeu de données sur les insectes aquatiques récoltés dans le cadre de la thèse de Rémi GERBER La période couvre 2020 et 2021 sur l'ensemble de l'Ille-et-Vilaine. L'échantillonnage a été réalisé soit de manière standardisé à l'aide d'un piège à émergence posé sur une zone aquatique, soit de manière spontanée à l'aide d'un filet ou à la main. Chaque donnée comprend la localisation de l'échantillonnage, le nom de l'espèce (ou du genre), la méthode de capture et le nombre d'individu récolté.
OSURIS