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Les données décrites dans ce document s’inscrivent dans le cadre du projet POLLIHAIE (2021-2023), financé par la Fondation de France. L’objectif général du projet est d’évaluer le rôle de la haie, des prairies et des cultures dans la fourniture spatiale et temporelle des ressources floricoles pour les pollinisateurs et la complémentarité de ces ressources. Les données comprennent des relevés d'insectes pollinisateurs (abeilles et syrphes) (abondances et espèces) et des relevés de flore (abondance et espèces en fleur). Les échantillonnages sont effectués tous les mois entre mars 2022 et septembre 2022, dans la ZA Armorique Sud (Sud de Rennes, Ille-et-Vilaine), sur 20 paysages d’étude (1km de rayon) présentant un gradient de densité de haies. Dans chaque paysage, 3 habitats sont choisis comme sites d’échantillonnage : une haie (habitat 2 sur la carte), une prairie de plus de 5 ans (habitat 3) et un champ de blé cultivé en agriculture biologique (habitat 1). Les échantillonnages d’insectes pollinisateurs se font le long d’un transect de 100m sur chacun de ces sites d’échantillonnage, pendant 15 minutes net. Seuls les insectes en interaction avec une fleurs sont relevés, et l'espèce de plante est notée. Tous les insectes ne pouvant être identifiés à l'espèce visuellement sont récoltés au filet, et transféré dans des pilluliers individuels. Toutes les plantes (dicotylédones) en fleurs sur le transect d'étude sont identifiées à l'espèce et leur recouvrement est estimé par un indice de Braün-Blanquet.
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Title: Necrosis is a major driver of thermal stress-induced mortality in Drosophila melanogaster larvae: cellular and molecular insights across acclimation phenotypes Authors: Fatemeh Saeidi & Hervé Colinet Affiliation: Université de Rennes, CNRS, ECOBIO (Ecosystèmes, biodiversité, évolution) – UMR 6553, 35000 Rennes, France This repository contains raw data files (in .txt format) associated with the study investigating cell death dynamics induced by cold (-3°C) and heat (38°C) stress in third-instar Drosophila melanogaster larvae. The study compared three acclimation phenotypes: - LNA: Non-acclimated larvae (reared at 25°C for 4 days) - LCA: Cold-acclimated larvae (reared at 15°C for 10 days) - LHA: Heat-acclimated larvae (reared at 30°C for 3 days) All data files are in tab-delimited text format (.txt). For detailed statistical methods, please refer to the Materials & Methods section of the associated manuscript. LNA : Non-acclimated larvae (reared at 25°C for 4 days) LCA : Cold-acclimated larvae (reared at 15°C for 10 days) LHA : Heat-acclimated larvae (reared at 30°C for 3 days) BS : Black spots (melanized lesions) NBS : No black spots Co : Unstressed control CTCF : Corrected total cell fluorescence ROS : Reactive oxygen species GLM : Generalized linear model GLMM : Generalized linear mixed model PCA : Principal component analysis RpL32 : Reference gene used for normalization
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Le CEVA a été chargé, de 2002 à 2006, de la mise en place puis de la réalisation du suivi du phénomène de « marées vertes » à l’échelle de la Bretagne, dans le cadre du programme Prolittoral, programme régional et interdépartemental de lutte contre les marées vertes (financement de l’Agence de l’Eau Loire Bretagne, du Conseil régional de Bretagne et des quatre Conseils généraux bretons). Dans ce cadre, le CEVA a développé des outils spécifiques pour évaluer le phénomène et son évolution. Ces outils ont été élaborés en partant de la connaissance du phénomène acquise au travers des suivis antérieurs, réalisés pour le compte du Conseil général des Côtes d’Armor, de l’Agence de l’Eau Loire Bretagne et de collectivités locales bretonnes particulièrement touchées par le phénomène. Depuis 2007, le CEVA réalise les inventaires de marées vertes du Réseau de Contrôle de Surveillance (RCS) dans le cadre de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) pour l’évaluation des masses d’eau côtières et de transition, financée par l’Agence de l’Eau Loire Bretagne. Trois survols sont réalisés chaque année (mai, juillet, septembre) de l’ensemble du littoral (du Mont Saint Michel à l’île de Ré) faisant l’objet de l’acquisition de photographies aériennes à partir desquelles des surfaces d’échouages d’ulves sont mesurées. Pour les sites de type « sableux » classés « site à échouage d’ulves », l’estimation surfacique des échouages d’ulves en lame est réalisée pour chaque inventaire. Pour les sites de type « vaseux » marqués par un tapis continu d’algues vertes, toutes les surfaces couvertes par les algues vertes (filamenteuses ou en lames) sont estimées uniquement pour l’inventaire présentant un maximal annuel de biomasse. Cela fait suite à la mise au point des grilles de classement européennes de la DCE des masses d’eau de type « abritées » (vasières) en 2008.
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dunes du nord Mali
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Le site d’Hyderabad (Inde) est situé dans un aquifère cristallin altéré et fracturé soumis à de fortes pressions anthropiques (pompages, intrants…) induites par les pratiques agricoles. Le site de Choutuppal (43 ha) constitue un observatoire expérimental local disposant d’une vingtaine de piézomètres entre lesquels des essais de pompages en interférences et essais de traçages peuvent être réalisés. Le bassin versant de Maheshwaram (55 km2) est caractérisé par une très forte activité agricole impactant le cycle de l’eau, le niveau de la nappe aquifère et sa qualité. Plusieurs centaines de forages abandonnés sont disponibles pour réaliser diverses investigations. Les questionnements scientifiques sont la compartimentation/hétérogénéité de l’aquifère de socle, les relations entre propriétés hydrodynamiques et paramètres de transport et finalement l’évolution de la composition chimique de l’eau souterraine en lien avec les activités anthropiques et le changement climatique. Les problèmes essentiels concernent la vulnérabilité de la population à la disponibilité de la ressource et sa qualité altérées par les activités anthropiques Le partenaire du site est le National Geophysical Research Institute qui possède le foncier de Choutuppal et possède un accord de collaboration avec les chefs de villages à Maheshwaram.
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carte des lacs au nord du Mali
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Ceci est un jeu de données sur les insectes aquatiques récoltés dans le cadre de la thèse de Rémi GERBER. La période couvre 2020 et 2021 autour du Ruisseau du Guyoult, à Trans-la-Forêt en Ille-et-Vilaine. L'échantillonnage a été réalisé sur un maillage autour du ruisseau, à l'aide de pièges à interceptions. Chaque donnée comprend la localisation du piège à interception, les espèces capturées et le nombre d'individu.
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Ceci est un jeu de données sur les insectes aquatiques récoltés dans le cadre de la thèse de Rémi GERBER La période couvre 2020 et 2021 sur l'ensemble de l'Ille-et-Vilaine. L'échantillonnage a été réalisé soit de manière standardisé à l'aide d'un piège à émergence posé sur une zone aquatique, soit de manière spontanée à l'aide d'un filet ou à la main. Chaque donnée comprend la localisation de l'échantillonnage, le nom de l'espèce (ou du genre), la méthode de capture et le nombre d'individu récolté.
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!! A mettre à jour !! (Accès dataset) "Relevés de carabes aux interfaces entre parcelles cultivées et leurs bordures (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier les flux et l'activité-densité associée des carabes entre cultures de différente nature (céréales d'hiver et maïs) et avec leurs bordures (haies), réparties dans 15 interfaces de cultures au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles et leurs bordures par piégeage, avec 2 stations de piégeage par parcelle et 2 stations de piégeage par bordure de champs (2 pots par station) ; échantillonnage des flux de carabes aux interfaces entre parcelles et entre parcelles et leurs bordures avec des pièges à interception (4 pots par piège à interception) ; pièges ouverts en continu et relevés toutes les 2 semaines pendant 8 semaines au printemps et pendant 4 semaines à l'automne. Programme de financement : projet DIVA AGRICONNECT Martel, G., Aviron, S., Joannon, A., Lalechère, E., Roche, B., & Boussard, H. (2017). Impact of farming systems on agricultural landscapes and biodiversity: From plot to farm and landscape scales. European Journal of Agronomy.
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Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de pollinisation Protocole : Dépôt de plants de radis en fleurs en bordure de parcelle, laissés libres à la pollinisation ou non, puis récolte et pesage des graines Article de référence : Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in Western Europe, Annika L. Hass, Urs G. Kormann, Teja Tscharntke, Yann Clough, Aliette Bosem Baillod, Clélia Sirami, Lenore Fahrig, Jean-Louis Martin, Jacques Baudry, Colette Bertrand, Jordi Bosch, Lluís Brotons, Françoise Burel, Romain Georges, David Giralt, María Á. Marcos-García, Antonio Ricarte, Gavin Siriwardena and Péter Batáry. Proceedings of the Royal Society London B, 14 février 2018. DOI : 10.1098/rspb.2017.2242 Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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