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  • L'étude de la végétation rivulaire repose sur l'observation des communautés végétales naturelles colonisant spontanément les surfaces nouvellement exposées suite à l’effacement des barrages de Vezins et de La-Roche-Qui-Boit. Le dispositif de suivi des végétations comprend deux approches complémentaires : i) une méthode d'échantillonnage des végétations basée sur la réalisation de relevés floristiques (composition & structure) effectués au sein d’une série de quadrats positionnés le long d’un transect ii) un suivi des Unités de Végétations (UV) observées au sein de la vallée Ce jeu de données concerne spécifiquement le suivi des quadrats utilisés dans la méthode d'échantillonnage des végétations, uniquement pour les données issues de l'Observatoire Sélune (2021-2026) Le dispositif de suivi par échantillonnage s’appuie sur des relevés distribués en différents points de l’espace (longitudinalement & latéralement). Il vise à identifier la diversité de la flore et des végétations et décrire la structure des formations & communautés végétales émergeantes au sein de la néo-vallée. Mis en œuvre annuellement (infra-annuel uniquement pour 2021, avant démantèlement), ce suivi vise à identifier et caractériser les trajectoires d’évolution de ces végétations au cours du temps. Le protocole d'échantillonnage de la végétation est mis en œuvre au droit de plusieurs stations situées le long du cours de la Sélune et à l’embouchure de plusieurs affluents situés dans l’emprise des deux anciennes retenues d’eau. L’échantillon de stations est complété par un lot de stations positionnées en dehors de l’emprise des deux anciennes retenues, à l’aval et à l’amont, et qui constituent des stations dites de « référence ». Pour chaque station, un transect est établi perpendiculairement au chenal, depuis la berge jusqu’à un point de référence situé au niveau de l’ancienne cote de la retenue d’eau (i.e. 60m NGF pour Vezins & 28.5m NGF pour LRQB). Le long de ce transect, des quadrats de 25m² (5mx5m) sont positionnés selon des intervalles de distances fixées préalablement. Ces quadrats (nommés Q1 à Q1+n) constituent l’unité élémentaire au sein de laquelle des paramètres abiotiques (pente, texture…) et biotiques (composition, structure) sont caractérisés et évalués. Le nombre de quadrat échantillonné par station varie en fonction de la largeur de rive exondée (ou longueur du transect). Il est complété par un quadrat de référence, situé au-delà de cette cote maximale (nommé Q0). L’inventaire de la flore vasculaire i.e. les espèces végétales herbacées et ligneuses au sein des quadrats vise l’exhaustivité et une identification jusqu’au rang spécifique, voire sub-spécifique. Cette couche donne, pour chaque quadrat de suivi de l'échantillonnage des végétations de 2021 à 2026, les informations suivantes : – Information sur le quadrat (id, code, numéro spécifique, distance au point de référence de la station) – Information de la campagne (id, code, date, campagne), – Information de la station (code, nom, protocole appliqué, nombre de quadrats, code du point de référence Sélune associé et, en découlant : positionnement sur le bassin versant, distance à la mer, distance à la source et cours d’eau) – Information sur le transect par campagne (numéro et longueur, coordonnées X, Y, LON, LAT des points de référence « NGF» et de fin « rive ») – Géométrie « point » correspondant au point de référence du transect ou de la station

  • Image Aster uniquement géoréférencée du Morbihan Sud, sur 9 bandes mesurant les longueurs d'ondes de 0.556 à 2.4 µm.

  • Carte des fossés du site d'étude INRA de Kervidy-Naizin. Cette carte a été levée en 2013. Une seule culture est renseignée cette année. La couche vecteur a été crée à partir des observations de terrain réalisées au mois de juin par Lucie CARRERA, Rémi DUPAS et Guillaume HUMBERT.

  • L’ouverture des barrages va considérablement impacter le fonctionnement des populations piscicoles de la Sélune. Le rétablissement de la continuité écologique du fleuve modifiera les flux populationnels en autorisant la remontée plus en amont de certaines espèces amphihalines et le déplacement d'autres espèces vers l'aval et en amont des barrages. Depuis maintenant de nombreuses années, dans le cadre de l'ORE DiaPFC (Observatoire de Recherche en Environnement Poissons Diadromes dans les Fleuves Côtiers), du SOERE OLA (Système d'Observation et d'Expérmentation pour la recherche en environnement Observatoire des lacs alpins) ou du Pôle OFB-INRAE-Institut Agro-UPPA, différentes unités INRAE (U3E, l'UMR ECOBIOP et l'UMR CARRTEL) et OFB (DRAS) prélèvent des échantillons sur de nombreux spécimens aquatiques. Ces échantillons, généralement otolithes, écailles et/ou nageoires, servent ensuite à la communauté scientifique pour effectuer différentes analyses et recherches. Ces prélèvements ont également lieu dans le cadre de l’observatoire Sélune. Labélisé Centre de Ressources Biologiques (CRB) par le GIS IBISA, Colisa fait partie du pilier environnement BRC4Env (réseau des Centres de Ressources Biologiques pour l'Environnement) de l'infrastructure RARe. Notre catalogue référence ces différents échantillons de tissus durs et propose un module permettant d'effectuer des requêtes sur notre base de données et de sélectionner les types de données susceptibles de vous intéresser. Vous pourrez par la suite exporter ces données. Ce jeu de données ne présente, en l’occurrence, aucune donnée spécifique mais permet le lien vers l'application COLISA (COLlection of Ichtyological SAmple : Collection d'échantillons ichtyologiques) permettant le stockage des échantillons prélevés. L'application COLISA nécessite la création d'un compte utilisateur pour l'accès à la totalité de la collection.

  • Représentation du réseau hydrographique sur la zone d'étude INRA de Naizin.

  • Categories    

    Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.

  • Les macrophytes sont un ensemble de plantes aquatiques. Elles se situent à la base de la chaine alimentaire et peuvent fournir un habitat à de nombreuses autres espèces. Dans le cadre de l'observatoire Sélune ont été disposées des stations pilotes le long du cours principal de la Sélune, réparties de l’amont à l’aval des barrages hydroélectriques. Trois stations se situent dans les anciennes retenues des barrages, les deux autres, dites de référence, sont hors zone d'influence des anciens barrages (l'une étant en aval et l'autre en amont). Dans ces stations, les biocénoses aquatiques (incluant macroinvertébrés benthiques, biofilms, macrophytes...) sont suivies. Les paramètres suivis sont la composition spécifique et le recouvrement, sur 8 stations du cours principal situées à l’amont, à l’aval et sur les zones néo-lotiques des communautés de macrophytes. La fréquence du suivi consiste en une campagne annuelle pour les stations hors retenues (S0, S1 et S5) et deux campagnes annuelles (printemps/automne) pour les stations néo-lotiques (S2, S3.4, S4.1 et S6). Le protocole mis en œuvre est le protocole d’échantillonnage des macrophytes et bryophytes suivant la norme NF T90-395 (octobre 2003) qui définit l’IBMR. Les taxa sont prélevés pour être identifiés en laboratoire. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le suivi des macrophytes ainsi que les campagnes réalisées et la mésologie identifiée sur ces différentes campagne.

  • Occupation des sols 2010 du bassin versant du site de Naizin dans le Morbihan dans le cadre de l'Observatoire de Recherche en Environnement (ORE) AgrHyS d'INRAE. Le parcellaire est issu du cadastre de 2013. Les dessertes ont été redessinées à partir des orthophotos IGN de 2013 et le parcellaire a été découpé en fonction d’une zone tampon autour de ces dessertes. Les parcelles 2013 peuvent être découpées mais jamais regroupées. Toutes les entités géographiques élémentaires ont un identifiant unique sur l’ensemble des années. Champs de la table d’attribut : • ID_2010 : identifiant de la parcelle pour l’année 2010 • TYPE_10 : code principal de l’occupation des sols • S_TYPE_10 : code secondaire de l’occupation des sols • NUM_ILOT : identifiant numérique et non significatif par îlot du RPG 2010 • CODE_GROUP : code des cultures de l’îlot regroupées du RPG 2010 La nomenclature de ces codes des types et sous-types a été définie dans le programme ANR-12-AGRO-0005 MOSAIC : https://anr.fr/Projet-ANR-12-AGRO-0005. Leurs descriptions peuvent être télécharger ici : https://geosas.fr/metadata/ore/xls/legendes_osol_naizin.xlsx. Les occupations des sols sont issues des données par ilot du Registre Parcellaire Graphique (RPG) de l’année 2010. Les limites des parcelles ont été mises en concordance avec le parcellaire de 2013.

  • Occupation des sols 2006 du bassin versant du site de Naizin dans le Morbihan dans le cadre de l'Observatoire de Recherche en Environnement (ORE) AgrHyS d'INRAE. Le parcellaire est issu du cadastre de 2013. Les dessertes ont été redessinées à partir des orthophotos IGN de 2013 et le parcellaire a été découpé en fonction d’une zone tampon autour de ces dessertes. Les parcelles 2013 peuvent être découpées mais jamais regroupées. Toutes les entités géographiques élémentaires ont un identifiant unique sur l’ensemble des années. Champs de la table d’attribut : • ID_2006 : identifiant de la parcelle pour l’année 2006 • TYPE_06 : code principal de l’occupation des sols • S_TYPE_06 : code secondaire de l’occupation des sols • ID_ILOT : Identifiant numérique et non significatif par îlot du RPG 2006 • CODE_GROUP : code du groupe de cultures du RPG 2006 La nomenclature de ces codes des types et sous-types a été définie dans le programme ANR-12-AGRO-0005 MOSAIC : https://anr.fr/Projet-ANR-12-AGRO-0005. Leurs descriptions peuvent être télécharger ici : https://geosas.fr/metadata/ore/xls/legendes_osol_naizin.xlsx. Les occupations des sols sont issues des données par ilot du Registre Parcellaire Graphique (RPG) de l’année 2006. Les limites des parcelles ont été mises en concordance avec le parcellaire de 2013.

  • Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".