!! A mettre à jour !! (Accès carto + dataset) Analyse des effets du contexte paysager et des parcelles adjacentes sur les communautés de coléoptères carabiques des haies, dans trois paysages bocagers de structure contrastée. Protocole : piégeage d’insectes par pots barber Une publication : Aviron, S., F. Burel, et al. (2005). "Carabid assemblages in agricultural landscapes: impacts of habitat features, landscape context at different spatial scales and farming intensity." Agriculture Ecosystems and Environment108(3): 205-217. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1') Financé par le ministère de l'écologie

Relevés exhaustifs de la flore des bords de champs des 3 mini-réseaux bocagers de la Zone Atelier Armorique à Pleine-Fougères. Protocole: placé le long d'une haie, sur un tronçon homogène; coefficient d'abondance-dominance des espèces (dans certains cas transect de 25m sur la longueur ou sur la totalité de la haie).

Communautés de prédateurs (carabes et araignées) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de prédateurs (carabes et araignées) Protocole : Échantillonnage par pièges à fosse (Barber) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Bertrand, C., Burel, F., & Baudry, J. (2016). Spatial and temporal heterogeneity of the crop mosaic influences carabid beetles in agricultural landscapes. Landscape Ecology, 31(2), 451-466. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Ce suivi a pour but d’analyser l’impact des facteurs abiotiques et de gestion agricole sur la structuration des communautés végétales de prairies humides. Protocole utilisé : 11 mailles paysagères de 500m de coté situées le long de la basse vallée du Couesnon. Au sein de la maille, choix de trois parcelles par mode de gestion (paturage, fauche, mixte). A l’intérieur de la parcelle, une zone tampon de 10m au sein de la parcelle est réalisée. Tous les habitats ont été échantillonnés au moins une fois, le nombre de relevés dépendant de leur abondance respective au sein de la parcelle. Un seul seul relevé en 2012. Les relevés floristiques sont réalisées selon la méthode de Braun-Blanquet

Etude du role des bandes enherbées sur le maintien de la biodiversité au sein des paysages agricoles. Cette étude a été réalisée dans le cadre d’un projet financé par la région Bretagne. Le protocole consistait à réaliser 3 transects au sein de la bande enherbée. Chaque transect est séparé de 50m Pour chaque transect, 4 quadrats de 2m*0.5m ont été effectués. Q1 : relevé dans la haie ou bordure Q2 : relevé à 5à cm de la bordure Q3 : centre de la BE Q4 : à 50 cm de la parcelle L’abondance-dominance de chaque espèce a été mesurée à l’aide des coefficients de Braun Blanquet. 47 bandes suivies : 46 en 2006, 53 en 2007 et 34 en 2008.. Article ref : Ernoult A, Vialatte A, Butet A, Michel N, Rantier Y, Jambon O, Burel F (2013). Grassy strips in their landscape context, their role as new habitat for biodiversity, Agriculture, Ecosystems & Environment, 166: 15-27 Programme de recherché : Projet SIE financement région Bretagne

Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

Objectif : Estimer l’abondance relative de micromammifères et leur portage pour certains agents pathogènes transmis par les tiques dans la Zone Atelier Armorique dans le cadre du programme de recherche OSCAR (Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage Agricole du Risque acarologique – 2012-2015). Nature de la donnée : Série de cinq échantillonnages : -Mai-Juin 2012 -Octobre 2012 -Mai-Juin 2013 -Septembre-Octobre 2013 -Mai 2014 Protocole : Pose de 34 pièges INRA sur vingt-quatre lignes de 100 mètres placées dans différents types de paysage (forêt, lisière de forêt, bocage ouvert et dense le long de lisières de bois ou de haies) puis relevés à 24 et 48 heures. Les animaux piégés ont subi une prise de sang puis ont été sacrifiés pour réaliser par la suite des analyses moléculaires sur différent organes (détection de Borrelia burgdoreferi sl., Anaplasma phagocytophylum et Babesia microti). Référence protocole : Michel, N., F. Burel, and A. Butet. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes? Acta Oecologica 30:11–20. 10.1016/j.actao.2005.12.006 Pas d'article de référence. OSUR - UMR Ecobio 6553 université de Rennes 1-CNRS — UMR BioEpAR1300 Oniris-INRA

Objectif : Tester l'effectivité des corridors écologiques dans la dispersion des papillons hétérocères au sein de Rennes Métropole. Protocole : Capture-marquage-recapture. Les papillons ont été capturés par l'intermédiaire de pièges lumineux au sein de différents parcs urbains de Rennes Métropole (zones sources), marqués puis recapturés par pièges lumineux durant les deux nuits suivant le marquage, le long de corridors identifiés ou au sein de la matrice urbaines. Contient: liste des espèces capturées + taux de recapture