Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.

Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

!! A mettre à jour !! (Accès carto + dataset) Analyse des effets du contexte paysager et des parcelles adjacentes sur les communautés de coléoptères carabiques des haies, dans trois paysages bocagers de structure contrastée. Protocole : piégeage d’insectes par pots barber Une publication : Aviron, S., F. Burel, et al. (2005). "Carabid assemblages in agricultural landscapes: impacts of habitat features, landscape context at different spatial scales and farming intensity." Agriculture Ecosystems and Environment108(3): 205-217. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1') Financé par le ministère de l'écologie

Objectif: Impact de l'urbanisation des terres sur les communautés de coléoptères carabidés de boisements. Méthodes: Échantillonnage des communautés (mai-juillet) de coléoptères carabidés dans 19 sites répartis le long d’un gradient rural-urbain (Rennes et sa périphérie). Série temporelle pour les coléoptères.

Objectif : Ce suivi a pour objectif d'analyser la dynamique végétale après semis des bandes enherbées expérimentales. Le semis a été réalisé en 2010 Sur les BE, les relevés floristiques ont été effectués en juin 2010, 3 mois après semis. Les quadrats utilisés sont de 2x2 m, positionnés à 3m du bord de la bande enherbée selon 10 points dans le sens de la longueur. Le pourcentage de recouvrement par rapport au sol des différentes espèces en présence a été évalué à l'estime avec une précision de 5%. Projet : ANR MODECOL Programme de recherche : Système Complexe et Modèlisation de l'ANR Coordinatrice : Cendrine Mony

Objectif : Estimer l’abondance relative de micromammifères et leur portage pour certains agents pathogènes transmis par les tiques dans la Zone Atelier Armorique dans le cadre du programme de recherche OSCAR (Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage Agricole du Risque acarologique – 2012-2015). Nature de la donnée : Série de cinq échantillonnages : -Mai-Juin 2012 -Octobre 2012 -Mai-Juin 2013 -Septembre-Octobre 2013 -Mai 2014 Protocole : Pose de 34 pièges INRA sur vingt-quatre lignes de 100 mètres placées dans différents types de paysage (forêt, lisière de forêt, bocage ouvert et dense le long de lisières de bois ou de haies) puis relevés à 24 et 48 heures. Les animaux piégés ont subi une prise de sang puis ont été sacrifiés pour réaliser par la suite des analyses moléculaires sur différent organes (détection de Borrelia burgdoreferi sl., Anaplasma phagocytophylum et Babesia microti). Référence protocole : Michel, N., F. Burel, and A. Butet. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes? Acta Oecologica 30:11–20. 10.1016/j.actao.2005.12.006 Pas d'article de référence. OSUR - UMR Ecobio 6553 université de Rennes 1-CNRS — UMR BioEpAR1300 Oniris-INRA

Comprendre la réponse des communautés d’oiseaux à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : Protocole : Le plan d’échantillonnage de la communauté d’oiseaux nicheurs a été basé sur la méthode STOC-EPS (Suivi Temporel des Oiseaux Communs par Echantillonnages Ponctuels Simples). Cet échantillonnage prévoit trois passages afin de couvrir la phénologie des oiseaux forestiers : un passage début avril pour capter les nicheurs précoces et deux passages en mai et juin pour les nicheurs tardifs et espèces migratrices. L’échantillonnage consiste en la réalisation de points d’écoute : afin d’optimiser les contacts, l’observateur écoute les chants et cris d’oiseaux pendant 5 minutes en étant placé au centre de la zone étudiée, ici du bois. L’objectif étant d’être le plus exhaustif possible, 5 minutes d’écoute ont été rajoutées afin d’augmenter les chances d’entendre l’ensemble des espèces présentes. L’étude étant focalisée sur les espèces forestières, seuls les individus nichant dans les bois ont été retenus. Les relevés ont été réalisés entre Avril et Juin 2012 Article de référence : Gil Tena,A., Lecerf, R., Ernoult A. (2013). Disentangling community assemblages to depict an indicator of biological connectivity: a regional study of fragmented semi-natural grasslands. Ecological Indicators, 24: 48-55. Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.

!! A mettre à jour !! (Accès dataset) Effet de l’hétérogénéité paysagère, et en particulier de l’hétérogénéité de la mosaïque agricole, sur la diversité des cultures : le cas des carabes. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille, 2 parcelles de maïs et 2 parcelles de céréale d’hiver (le plus souvent du blé)ont été échantillonnés (soit 4 parcelles par maille au total)Plusieurs sessions de piégeage ont eu lieu entre mai et septembre 2012. Protocole : 2 points d’échantillonnage par parcelles, 2 pièges Barber par point d’échantillonnage,4 périodes d’échantillonnage pour les céréales d’hiver au printemps, 7 périodes d’échantillonnage pour le maïs (4 au printemps et 3 en fin d’été). Les périodes d’échantillonnage correspondent à une ouverture des pièges pendant 1 semaine. Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf :Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity as an ecological filter of species traits. Acta Oecologica, 56: 19-26.