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Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.
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Caractérisation de la diversité gamma des plantes du nord de l’ille et vilaine (2011): Effet de l’hétérogénéité paysagère sur la diversité gamma : le cas de la végétation. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille : 5 habitats échantillonnés : les bois, les prairies permanentes, les prairies temporaires, les cultures et les haies. Pour mesurer la diversité gamma, 2 réplicats de chaque habitat ont été choisis : 10 relevés par maille. Pour chaque habitat 3 quadrats sont effectués Pour les prairies et les cultures, les quadrats sont de 2m*2m positionnés à 2, 6, et 10m de la bordure (Q1, Q2, Q3 respectivement). Pour les bois, les quadrats sont de 5m*5m et séparés d’une distance de 5m (de la bordure vers le centre : Q1, Q2, Q3). Les haies sont échantillonnées par 3 quadrats de 5m*2m séparés de 5m chacun. Les relevés ont été réalisés entre Mai et Aout 2011 Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf : Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity
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"Diversité gamma des carabes (Nord Ille et Vilaine, 2011) Zone Atelier Armorique ZAAr" Caractérisation de la diversité gamma des carabes du Nord de l’Ille et Vilaine (2011) Effet de l’hétérogénéité paysagère sur la diversité gamma : le cas des carabes. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille : 5 habitats échantillonnés : les bois, les prairies permanentes, les prairies temporaires, les cultures et les haies. Pour mesurer la diversité gamma, 2 réplicats de chaque habitat ont été choisis : 10 relevés par maille.Plusieurs sessions de piégeage ont eu lieu entre mai et septembre 2011. Protocole : 2 pièges Barber par point d’échantillonnage, 4 périodes d’échantillonnage pour les céréales d’hiver, 6 périodes d’échantillonnage pour les autres types d’habitat. Les périodes d’échantillonnage correspondent à une ouverture des pièges pendant 1 semaine. Les relevés ont été réalisés entre Mai et Septembre 2011 Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf : Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity as an ecological filter of species traits. Acta Oecologica, 56: 19-26.
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Objectif : Estimer l’abondance relative de micromammifères et leur portage pour certains agents pathogènes transmis par les tiques dans la Zone Atelier Armorique dans le cadre du programme de recherche OSCAR (Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage Agricole du Risque acarologique – 2012-2015). Nature de la donnée : Série de cinq échantillonnages : -Mai-Juin 2012 -Octobre 2012 -Mai-Juin 2013 -Septembre-Octobre 2013 -Mai 2014 Protocole : Pose de 34 pièges INRA sur vingt-quatre lignes de 100 mètres placées dans différents types de paysage (forêt, lisière de forêt, bocage ouvert et dense le long de lisières de bois ou de haies) puis relevés à 24 et 48 heures. Les animaux piégés ont subi une prise de sang puis ont été sacrifiés pour réaliser par la suite des analyses moléculaires sur différent organes (détection de Borrelia burgdoreferi sl., Anaplasma phagocytophylum et Babesia microti). Référence protocole : Michel, N., F. Burel, and A. Butet. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes? Acta Oecologica 30:11–20. 10.1016/j.actao.2005.12.006 Pas d'article de référence. OSUR - UMR Ecobio 6553 université de Rennes 1-CNRS — UMR BioEpAR1300 Oniris-INRA
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"Relevés floristiques des prairies de fonds de vallée de 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune, 2017" Protocole: La méthode consiste en un échantillonnage exhaustif de la végétation vasculaire des parcelles de prairies de fond de vallée, au niveau de 20 quadrats de 1m² (1m x 1m) disposés de part et d'autre de 5 transects équidistants (transversaux par rapport au cours d'eau). Dix quadrats sont positionnés de part et d'autre de chacun de ces transects à 1m du bord de la parcelle (côté Sélune) , on les appellera "quadrats de bord". Les dix autres sont également positionnés de part et d'autre de chacun des transects, mais à une distance à la bordure égale à la moitié de la longueur des transects. On les appellera "quadrats de centre". A chaque espèce identifiée est attribué un coefficient d'abondance-dominance d'après l'échelle de Braun Blanquet. Projet de recherche: Seripage Site du projet: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE
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Suivi de communautés de carabes dans les mini-réseaux de haies dans 3 paysages contrastés aux alentours de Pleine-Fougères. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1')
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Suivi de carabes dans les haies (Pleine-fougères, secteur C, 2007-...) - Zone Atelier Armorique ZAAr
"Suivi de la communauté des carabes sur de haie des 3 mini réseaux de la ZA (mini réseau C de la Pleine-fougères)" Ce suivi s'inscrit dans le suivi des communauté de carabes des haies des mini-réseaux de la Zone Atelier Armorique (site de Pleine-fougères). Dans le mini-réseau C, 10 haies ont été choisies en fonction de leur structure (strate arborescente, strate arbustive, talus, fossé...). Dans chaque haie sont positionnés 3 pot-barbers écartés de 1 à 2 m de distance. Ces pots-pièges sont positionnés au milieu de la haie. Pour chaque année d'étude, les pièges sont ouverts en continu, de fin avril à début octobre, par session de 15 jours. Ce suivi est effectué tous les 2 ans: 2007, 2009, 2011, 2013, 2015, 2017, 2019.
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Objectif : Ce suivi a pour objectif d'analyser la banque de graines du sol des bandes enherbées expérimentales avant semis Les échantillons du sol ont été prélevés entre mars et mai 2010, avant semis. Les points de prélèvement se situent à 3m du bord de chaque bande, sur 10 points dans le sens de la longueur. Ces derniers ont été mis en culture sous serre , selon le protocole de Ter heerdt et al., 1997. Le nombre de pieds de chaque espèce a été recensé Projet : ANR MODECOL Programme de recherche : Système Complexe et Modèlisation de l'ANR Coordinatrice : Cendrine Mony
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Objectif : Cette opération consiste à suivre les effectifs de cette espèce au cours du temps et de lier la dynamique observée avec les actions menées. Programme de recherche : Convention d'étude avec la communauté des communes de la baie du Mont St-Michel Coordinatrice : Cendrine Mony
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Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de pollinisation Protocole : Dépôt de plants de radis en fleurs en bordure de parcelle, laissés libres à la pollinisation ou non, puis récolte et pesage des graines Article de référence : Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in Western Europe, Annika L. Hass, Urs G. Kormann, Teja Tscharntke, Yann Clough, Aliette Bosem Baillod, Clélia Sirami, Lenore Fahrig, Jean-Louis Martin, Jacques Baudry, Colette Bertrand, Jordi Bosch, Lluís Brotons, Françoise Burel, Romain Georges, David Giralt, María Á. Marcos-García, Antonio Ricarte, Gavin Siriwardena and Péter Batáry. Proceedings of the Royal Society London B, 14 février 2018. DOI : 10.1098/rspb.2017.2242 Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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