Objectif: Impact de l'urbanisation des terres sur les communautés de coléoptères carabidés de boisements. Méthodes: Échantillonnage des communautés (mai-juillet) de coléoptères carabidés dans 19 sites répartis le long d’un gradient rural-urbain (Rennes et sa périphérie). Série temporelle pour les coléoptères.

Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.

"Relevés de la structure des bordures des champs sur les 3 mini-réseaux (A, B et C) de la ZAAr, 2015" Relevés de la structure des bordures de champs sur les 3 mini-réseaux (site A, B et C) de la Zone Atelier Armorique. Les variables mesurées sont la largeur de la bordure, la longueur de la bordure, la présence ou non de talus, la hauteur de talus, la présence ou non de fossé, la profondeur du fossé, la présence ou non de clôture, la localisation de la clôture. En parallèle, sur un échantillon de bordure, c'est-à-dire sur un tronçon de 25m de long représentatif de la physionomie générale de la bordure: 1) caractérisation de la structure verticale de la bordure: observation de la présence ou non de strate arbustive (si oui, évaluation en % de l'échantillon de bordure), présence ou non de strate arborée (si oui, évaluation en % de la longueur de l'échantillon de bordure + mesure de la hauteur dominante de la canopée + mesure de la largeur de la canopée), 2) notation des espèces arbustives dominantes, notation des espèces arborées dominantes, 3) estimation du % sol nu, du % de litière, du % de rocher sur la longueur de l'échantillon de bordure. Valorisation: Alignier A. (2018) Changes in a field margin vegetation metacommunity over a 21-year interval and the impacts of structural condition and management. Agriculture, Ecosystems and Environment, 251, 1-10

!! A mettre à jour !! (Accès dataset) Effet de l’hétérogénéité paysagère, et en particulier de l’hétérogénéité de la mosaïque agricole, sur la diversité des cultures : le cas des carabes. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille, 2 parcelles de maïs et 2 parcelles de céréale d’hiver (le plus souvent du blé)ont été échantillonnés (soit 4 parcelles par maille au total)Plusieurs sessions de piégeage ont eu lieu entre mai et septembre 2012. Protocole : 2 points d’échantillonnage par parcelles, 2 pièges Barber par point d’échantillonnage,4 périodes d’échantillonnage pour les céréales d’hiver au printemps, 7 périodes d’échantillonnage pour le maïs (4 au printemps et 3 en fin d’été). Les périodes d’échantillonnage correspondent à une ouverture des pièges pendant 1 semaine. Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf :Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity as an ecological filter of species traits. Acta Oecologica, 56: 19-26.

Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur la biodiversité et les services écosystémiques Protocole : Occupation du sol réalisée par inventaire terrain Article de référence : à venir Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Objectif : Cette tâche vise à étudier la dynamique de la végétation après exclusion de la pression de pâturage. Un exclos au sein de chaque communauté a été mis en place en 2007 pour les communautés mésophile, mésohygrophile et hygrophile et en 2011 dan la prairie à glycérie. Un exclos sera également mis en place en 2011 dans le prolongement de la rosière du secteur Nord pour permettre une extension de sa surface. Programme de recherche : Convention d'étude avec la communauté des communes de la baie du Mont St-Michel Coordinatrice : Cendrine Mony

!! A mettre à jour !! (Accès dataset) "Relevés de carabes aux interfaces entre parcelles cultivées et leurs bordures (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier les flux et l'activité-densité associée des carabes entre cultures de différente nature (céréales d'hiver et maïs) et avec leurs bordures (haies), réparties dans 15 interfaces de cultures au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles et leurs bordures par piégeage, avec 2 stations de piégeage par parcelle et 2 stations de piégeage par bordure de champs (2 pots par station) ; échantillonnage des flux de carabes aux interfaces entre parcelles et entre parcelles et leurs bordures avec des pièges à interception (4 pots par piège à interception) ; pièges ouverts en continu et relevés toutes les 2 semaines pendant 8 semaines au printemps et pendant 4 semaines à l'automne. Programme de financement : projet DIVA AGRICONNECT Martel, G., Aviron, S., Joannon, A., Lalechère, E., Roche, B., & Boussard, H. (2017). Impact of farming systems on agricultural landscapes and biodiversity: From plot to farm and landscape scales. European Journal of Agronomy.

Objectif : Estimer l’abondance relative de micromammifères et leur portage pour certains agents pathogènes transmis par les tiques dans la Zone Atelier Armorique dans le cadre du programme de recherche OSCAR (Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage Agricole du Risque acarologique – 2012-2015). Nature de la donnée : Série de cinq échantillonnages : -Mai-Juin 2012 -Octobre 2012 -Mai-Juin 2013 -Septembre-Octobre 2013 -Mai 2014 Protocole : Pose de 34 pièges INRA sur vingt-quatre lignes de 100 mètres placées dans différents types de paysage (forêt, lisière de forêt, bocage ouvert et dense le long de lisières de bois ou de haies) puis relevés à 24 et 48 heures. Les animaux piégés ont subi une prise de sang puis ont été sacrifiés pour réaliser par la suite des analyses moléculaires sur différent organes (détection de Borrelia burgdoreferi sl., Anaplasma phagocytophylum et Babesia microti). Référence protocole : Michel, N., F. Burel, and A. Butet. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes? Acta Oecologica 30:11–20. 10.1016/j.actao.2005.12.006 Pas d'article de référence. OSUR - UMR Ecobio 6553 université de Rennes 1-CNRS — UMR BioEpAR1300 Oniris-INRA

Comprendre la réponse des communautés végétales à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : La caractérisation des communautés végétales des bois a été faite à partir de relevés réalisés dans six quadrats de 14mx5m, selon un échantillonnage systématique dans chaque bois afin de prendre en compte leur éventuelle hétérogénéité. Trois sont placés le long de la lisière et trois en cœur, afin de mettre en évidence un éventuel « effet lisière ». La lisière a été définie à partir des premiers arbres (DBH>10 cm) et le cœur est la zone centrale du bois, à partir de 25m à la lisière, les principaux effets de lisière s’opérant dans les 20 premiers mètres à la bordure. La forme allongée des quadrats permet de prendre en compte l’hétérogénéité le long des lisières. L’échantillonnage couvre donc une surface de 210m2 en lisière et en cœur et 420m2 dans tout le bois, ce qui est en accord avec l’aire minimale requise pour caractériser les communautés végétales forestières (100 à 400 m2). Les pourcentages de recouvrement des plantes herbacées, arbustives et des arbres (canopée) ont été relevés dans chaque quadrat. Compte-tenu de l’emploi du temps, un seul passage a été effectué, à la fin du mois de juin afin d’augmenter les chances de capter à la fois les espèces précoces et les espèces tardives. Les relevés ont été réalisés en Juin 2012 Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.