Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

Analyse des effets du contexte paysager et des parcelles adjacentes sur les communautés de coléoptères carabiques des haies, dans trois paysages bocagers de structure contrastée. Protocole : piégeage d’insectes par pots barber Une publication : Aviron, S., F. Burel, et al. (2005). "Carabid assemblages in agricultural landscapes: impacts of habitat features, landscape context at different spatial scales and farming intensity." Agriculture Ecosystems and Environment108(3): 205-217. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1') Financé par le ministère de l'écologie

Objectif : étudier la hauteur du couvert au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : mesurer la hauteur du couvert dans 4 stations de piégeages de chaque parcelle. Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inrae.fr/

"Relevés de la structure des bordures des champs sur les 3 mini-réseaux (A, B et C) de la ZAAr, 2015" Relevés de la structure des bordures de champs sur les 3 mini-réseaux (site A, B et C) de la Zone Atelier Armorique. Les variables mesurées sont la largeur de la bordure, la longueur de la bordure, la présence ou non de talus, la hauteur de talus, la présence ou non de fossé, la profondeur du fossé, la présence ou non de clôture, la localisation de la clôture. En parallèle, sur un échantillon de bordure, c'est-à-dire sur un tronçon de 25m de long représentatif de la physionomie générale de la bordure: 1) caractérisation de la structure verticale de la bordure: observation de la présence ou non de strate arbustive (si oui, évaluation en % de l'échantillon de bordure), présence ou non de strate arborée (si oui, évaluation en % de la longueur de l'échantillon de bordure + mesure de la hauteur dominante de la canopée + mesure de la largeur de la canopée), 2) notation des espèces arbustives dominantes, notation des espèces arborées dominantes, 3) estimation du % sol nu, du % de litière, du % de rocher sur la longueur de l'échantillon de bordure. Valorisation: Alignier A. (2018) Changes in a field margin vegetation metacommunity over a 21-year interval and the impacts of structural condition and management. Agriculture, Ecosystems and Environment, 251, 1-10

"Suivi de la communauté de carabes des haies (mini réseau B) - ZAAr" Ce suivi s'inscrit dans le suivi des communauté de carabes des haies des mini-réseaux de la Zone Atelier Armorique (site de Pleine-fougères). Dans le mini-réseau B, 10 haies ont été choisies en fonction de leur structure (strate arborescente, strate arbustive, talus, fossé...). Dans chaque haie sont positionnés 3 pot-barbers écartés de 1 à 2 m de distance. Ces pots-pièges sont positionnés au milieu de la haie. Pour chaque année d'étude, les pièges sont ouverts en continu, de fin avril à début octobre, par session de 15 jours. Ce suivi est effectué tous les 2 ans: 2007, 2009, 2011, 2013, 2015, 2017, 2019.

"Relevés carabes dans une mosaïque de quelques parcelles cultivées et leurs bordures sur la zone atelier de Pleine Fougères" Objectif : étudier la dynamique spatiale et saisonnière des carabes au sein 6 parcelles cultivées et leurs bordures. Protocole : échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) par piégeage, avec 5 stations de piégeage par parcelle et 2 stations de piégeage par bordure de champs (2 pots par station) ; pièges ouverts en continu et relevés toutes les semaines pendant 17 semaines. Programme de financement : projet ANR BIODIVAGRIM Publication en cours de rédaction.

Comprendre la réponse des communautés d’oiseaux à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : Protocole : Le plan d’échantillonnage de la communauté d’oiseaux nicheurs a été basé sur la méthode STOC-EPS (Suivi Temporel des Oiseaux Communs par Echantillonnages Ponctuels Simples). Cet échantillonnage prévoit trois passages afin de couvrir la phénologie des oiseaux forestiers : un passage début avril pour capter les nicheurs précoces et deux passages en mai et juin pour les nicheurs tardifs et espèces migratrices. L’échantillonnage consiste en la réalisation de points d’écoute : afin d’optimiser les contacts, l’observateur écoute les chants et cris d’oiseaux pendant 5 minutes en étant placé au centre de la zone étudiée, ici du bois. L’objectif étant d’être le plus exhaustif possible, 5 minutes d’écoute ont été rajoutées afin d’augmenter les chances d’entendre l’ensemble des espèces présentes. L’étude étant focalisée sur les espèces forestières, seuls les individus nichant dans les bois ont été retenus. Les relevés ont été réalisés entre Avril et Juin 2012 Article de référence : Gil Tena,A., Lecerf, R., Ernoult A. (2013). Disentangling community assemblages to depict an indicator of biological connectivity: a regional study of fragmented semi-natural grasslands. Ecological Indicators, 24: 48-55. Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.

Objectif: Impact de l'urbanisation des terres sur la température locale au sein de petits boisements répartis le long d'un gradient rural-urbain (Rennes et sa périphérie). Méthodes : Relevés de Températures atmosphériques (Tinytags). Séries temporelles.

"Relevés de carabes en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la diversité spécifique et l'activité-densité des prédateurs (carabes) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles, avec 4 stations de piégeage par parcelle (2 pots par station); pièges ouverts pendant 4 jours à 2 périodes (mai et juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; PREPARE; SEBIOPAG-STAR; STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/ Suivis réalisés en 2014, 2015, 2016, 2018, 2021 et 2023

"155 outils et méthodes d'observation de la biodiversité: base de données excel et résumé des fonctions de chaque outil (2017)" Cette base de données à été crée en 2017 par Ninon Chauvy lors de son stage de Licence Professionnelle intitulé "Outils et méthodes d'évaluation de la biodiversité à l'échelle de l'exploitation". Le stage de Ninon Chauvy a été encadré par Audrey Alignier (audrey.alignier@inra.fr) et Bénédicte Roche (benedicte.roche@inrae.fr) de l'UMR INRAE 0980 BAGAP. Le stage avait pour objectif de faire un état des lieux des outils et méthodes d'observaiton de la biodiversité. Ce stage s'inscrit dans le cadre du projet PEI-Agri 2017 "Favoriser l'autonomie des agriculteurs dans l'évaluation de la biodiversité sur leur exploitation".Ce projet est porté conjointement par la FRCIVAM (Hélène Roisille), Bretagne Vivante (Luc Guihard) et l'INRAE UMR 0980 BAGAP (Audrey Alignier et Bénédicte Roche).Ce projet a été soutenu par le Fonds européen agricole pour le développement rural – FEADER