Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.

Relevés exhaustifs de la flore des bords de champs des 3 mini-réseaux bocagers de la Zone Atelier Armorique à Pleine-Fougères. Protocole: placé le long d'une haie, sur un tronçon homogène; coefficient d'abondance-dominance des espèces (dans certains cas transect de 25m sur la longueur ou sur la totalité de la haie).

!! A mettre à jour !! (Accès carto + dataset) Analyse des effets du contexte paysager et des parcelles adjacentes sur les communautés de coléoptères carabiques des haies, dans trois paysages bocagers de structure contrastée. Protocole : piégeage d’insectes par pots barber Une publication : Aviron, S., F. Burel, et al. (2005). "Carabid assemblages in agricultural landscapes: impacts of habitat features, landscape context at different spatial scales and farming intensity." Agriculture Ecosystems and Environment108(3): 205-217. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1') Financé par le ministère de l'écologie

!! A mettre à jour !! (Accès au dataset et à la carto) "Diversité gamma des carabes (Nord Ille et Vilaine, 2011) Zone Atelier Armorique ZAAr" Caractérisation de la diversité gamma des carabes du Nord de l’Ille et Vilaine (2011) Effet de l’hétérogénéité paysagère sur la diversité gamma : le cas des carabes. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille : 5 habitats échantillonnés : les bois, les prairies permanentes, les prairies temporaires, les cultures et les haies. Pour mesurer la diversité gamma, 2 réplicats de chaque habitat ont été choisis : 10 relevés par maille.Plusieurs sessions de piégeage ont eu lieu entre mai et septembre 2011. Protocole : 2 pièges Barber par point d’échantillonnage, 4 périodes d’échantillonnage pour les céréales d’hiver, 6 périodes d’échantillonnage pour les autres types d’habitat. Les périodes d’échantillonnage correspondent à une ouverture des pièges pendant 1 semaine. Les relevés ont été réalisés entre Mai et Septembre 2011 Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf : Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity as an ecological filter of species traits. Acta Oecologica, 56: 19-26.

!! A mettre à jour !! (Accès dataset et carto) "Relevés carabes dans une mosaïque de quelques parcelles cultivées et leurs bordures sur la zone atelier de Pleine Fougères" Objectif : étudier la dynamique spatiale et saisonnière des carabes au sein 6 parcelles cultivées et leurs bordures. Protocole : échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) par piégeage, avec 5 stations de piégeage par parcelle et 2 stations de piégeage par bordure de champs (2 pots par station) ; pièges ouverts en continu et relevés toutes les semaines pendant 17 semaines. Programme de financement : projet ANR BIODIVAGRIM Publication en cours de rédaction.

Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de plantes Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Alignier, A., Solé‐Senan, X. O., Robleño, I., Baraibar, B., Fahrig, L., Giralt, D., ... & Batáry, P. (2020). Configurational crop heterogeneity increases within‐field plant diversity. Journal of Applied Ecology, 57(4), 654-663. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

!! A mettre à jour !! (Accès jeu de données) "Relevés de flore en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la flore au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - Dix quadrats de 50 * 50 cm, positionnés tous les 3 mètres sur une bande située à 50m de la bordure de la parcelle (cf. schéma ci-dessous). Pour chacun noter : - le % de recouvrement pour : adventices total, graminées, dicotylédones, espèce dominante, espèces en montaison (attention graminées, fleurs discrètes) - le nombre d’espèces total, graminées, dicotylédones. Ces suivis ont été effectués en 2014, 2015, 2018, 2021 et 2023 Programmes de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; projet PREPARE; projet STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/

Suivi temporel de la diversité et de l’abondance des communautés de petits mammifères sur les réseaux de haies du bocage et des digues plantées de la zone des polders . 24 haies (16 en bocage, 8 en polders). 7 sessions de piégeage : Avril, mai, juin, aout, sept, oct 2003 et Fev 2004 Méthode : line transect : 34 pièges INRA appâtés espacés tous les 3 mètres sur un transect de 100 mètres. Relevés à 24 et 48 heures Articles de références : -Michel, N., Burel, F. and Butet, A. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes ? Acta oecologica, 30 : 11-20 -Michel, N., Burel, F., Legendre, P. & Butet, A. 2007. Role of habitat and landscape in structuring small mammal assemblages in hedgerow networks of contrasted farming landscapes in Brittany, France. Landscape Ecology, 22 : 1241-1253. Pas de programme particulier

Objectif : Estimer l’abondance relative de micromammifères et leur portage pour certains agents pathogènes transmis par les tiques dans la Zone Atelier Armorique dans le cadre du programme de recherche OSCAR (Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage Agricole du Risque acarologique – 2012-2015). Nature de la donnée : Série de cinq échantillonnages : -Mai-Juin 2012 -Octobre 2012 -Mai-Juin 2013 -Septembre-Octobre 2013 -Mai 2014 Protocole : Pose de 34 pièges INRA sur vingt-quatre lignes de 100 mètres placées dans différents types de paysage (forêt, lisière de forêt, bocage ouvert et dense le long de lisières de bois ou de haies) puis relevés à 24 et 48 heures. Les animaux piégés ont subi une prise de sang puis ont été sacrifiés pour réaliser par la suite des analyses moléculaires sur différent organes (détection de Borrelia burgdoreferi sl., Anaplasma phagocytophylum et Babesia microti). Référence protocole : Michel, N., F. Burel, and A. Butet. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes? Acta Oecologica 30:11–20. 10.1016/j.actao.2005.12.006 Pas d'article de référence. OSUR - UMR Ecobio 6553 université de Rennes 1-CNRS — UMR BioEpAR1300 Oniris-INRA