Communautés de prédateurs (carabes et araignées) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de prédateurs (carabes et araignées) Protocole : Échantillonnage par pièges à fosse (Barber) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Bertrand, C., Burel, F., & Baudry, J. (2016). Spatial and temporal heterogeneity of the crop mosaic influences carabid beetles in agricultural landscapes. Landscape Ecology, 31(2), 451-466. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Relevés exhaustifs de la flore des bords de champs des 3 mini-réseaux bocagers de la Zone Atelier Armorique à Pleine-Fougères. Protocole: placé le long d'une haie, sur un tronçon homogène; coefficient d'abondance-dominance des espèces (dans certains cas transect de 25m sur la longueur ou sur la totalité de la haie).

Le jeu de données comprend la vitesse de décomposition en milieux aquatique, terrestre humide et terrestre sec dans la forêt de Villecartier pour 18 espèces d'arbres (..........................................). Les caractéristiques chimiques (composition élémentaire C,N,P; teneur en phénol/polyphénol, cellulose, hémicellulose, métaboliques secondaires, terpènes, micronutriments) ainsi que leurs caractéristiques physiques (dureté, épaisseur, SLA, capacités de retention en eau) ont également été mesurées. De plus, la colonisation par les invertébrés et la biomasse microbienne (par mesure de respiration par la méthode SIR) ont été mesurées dans chaque milieux et pour chaque type de feuille. Des données sur les communautés d'invertébrés et les conditions climatiques (température, hygrométrie) des sites sont également disponibles

!! A mettre à jour !! (Accès dataset) Effet de l’hétérogénéité paysagère, et en particulier de l’hétérogénéité de la mosaïque agricole, sur la diversité des cultures : le cas des carabes. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille, 2 parcelles de maïs et 2 parcelles de céréale d’hiver (le plus souvent du blé)ont été échantillonnés (soit 4 parcelles par maille au total)Plusieurs sessions de piégeage ont eu lieu entre mai et septembre 2012. Protocole : 2 points d’échantillonnage par parcelles, 2 pièges Barber par point d’échantillonnage,4 périodes d’échantillonnage pour les céréales d’hiver au printemps, 7 périodes d’échantillonnage pour le maïs (4 au printemps et 3 en fin d’été). Les périodes d’échantillonnage correspondent à une ouverture des pièges pendant 1 semaine. Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf :Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity as an ecological filter of species traits. Acta Oecologica, 56: 19-26.

Objectif : Estimer l’abondance relative de micromammifères et leur portage pour certains agents pathogènes transmis par les tiques dans la Zone Atelier Armorique dans le cadre du programme de recherche OSCAR (Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage Agricole du Risque acarologique – 2012-2015). Nature de la donnée : Série de cinq échantillonnages : -Mai-Juin 2012 -Octobre 2012 -Mai-Juin 2013 -Septembre-Octobre 2013 -Mai 2014 Protocole : Pose de 34 pièges INRA sur vingt-quatre lignes de 100 mètres placées dans différents types de paysage (forêt, lisière de forêt, bocage ouvert et dense le long de lisières de bois ou de haies) puis relevés à 24 et 48 heures. Les animaux piégés ont subi une prise de sang puis ont été sacrifiés pour réaliser par la suite des analyses moléculaires sur différent organes (détection de Borrelia burgdoreferi sl., Anaplasma phagocytophylum et Babesia microti). Référence protocole : Michel, N., F. Burel, and A. Butet. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes? Acta Oecologica 30:11–20. 10.1016/j.actao.2005.12.006 Pas d'article de référence. OSUR - UMR Ecobio 6553 université de Rennes 1-CNRS — UMR BioEpAR1300 Oniris-INRA

Objectif : Cette tâche vise à étudier la dynamique de la végétation après exclusion de la pression de pâturage. Un exclos au sein de chaque communauté a été mis en place en 2007 pour les communautés mésophile, mésohygrophile et hygrophile et en 2011 dan la prairie à glycérie. Un exclos sera également mis en place en 2011 dans le prolongement de la rosière du secteur Nord pour permettre une extension de sa surface. Programme de recherche : Convention d'étude avec la communauté des communes de la baie du Mont St-Michel Coordinatrice : Cendrine Mony

Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

Suivi temporel de la diversité et de l’abondance des communautés de petits mammifères sur les réseaux de haies du bocage et des digues plantées de la zone des polders . 24 haies (16 en bocage, 8 en polders). 7 sessions de piégeage : Avril, mai, juin, aout, sept, oct 2003 et Fev 2004 Méthode : line transect : 34 pièges INRA appâtés espacés tous les 3 mètres sur un transect de 100 mètres. Relevés à 24 et 48 heures Articles de références : -Michel, N., Burel, F. and Butet, A. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes ? Acta oecologica, 30 : 11-20 -Michel, N., Burel, F., Legendre, P. & Butet, A. 2007. Role of habitat and landscape in structuring small mammal assemblages in hedgerow networks of contrasted farming landscapes in Brittany, France. Landscape Ecology, 22 : 1241-1253. Pas de programme particulier

Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de pollinisation Protocole : Dépôt de plants de radis en fleurs en bordure de parcelle, laissés libres à la pollinisation ou non, puis récolte et pesage des graines Article de référence : Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in Western Europe, Annika L. Hass, Urs G. Kormann, Teja Tscharntke, Yann Clough, Aliette Bosem Baillod, Clélia Sirami, Lenore Fahrig, Jean-Louis Martin, Jacques Baudry, Colette Bertrand, Jordi Bosch, Lluís Brotons, Françoise Burel, Romain Georges, David Giralt, María Á. Marcos-García, Antonio Ricarte, Gavin Siriwardena and Péter Batáry. Proceedings of the Royal Society London B, 14 février 2018. DOI : 10.1098/rspb.2017.2242 Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

"Suivi de la communauté de carabes des haies (mini réseau B) - ZAAr" Ce suivi s'inscrit dans le suivi des communauté de carabes des haies des mini-réseaux de la Zone Atelier Armorique (site de Pleine-fougères). Dans le mini-réseau B, 10 haies ont été choisies en fonction de leur structure (strate arborescente, strate arbustive, talus, fossé...). Dans chaque haie sont positionnés 3 pot-barbers écartés de 1 à 2 m de distance. Ces pots-pièges sont positionnés au milieu de la haie. Pour chaque année d'étude, les pièges sont ouverts en continu, de fin avril à début octobre, par session de 15 jours. Ce suivi est effectué tous les 2 ans: 2007, 2009, 2011, 2013, 2015, 2017, 2019.