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Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.
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Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".
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Importance des bandes enherbées dans le fonctionnement de la communauté des syrphes entomophages en sein des paysages agricoles Protocole : 10 couples de parcelles de blé échantillonnées : 10 avec présence de BE et 10 sans BE. Pour les 20 parcelles : 3 pièges jaune par parcelle à 20m de la bordure. Pièges distants de 10m Pour les 9 BE : 2 pièges jaunes espacés de 10m. Suivis de mi avril à mi juillet 2008 Article de référence : Ernoult A, Vialatte A, Butet A, Michel N, Rantier Y, Jambon O, Burel F (2013). Grassy strips in their landscape context, their role as new habitat for biodiversity, Agriculture, Ecosystems & Environment, 166: 15-27 Programme interdisciplinaire CNRS CEMAGREF Ingénierie Écologique
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!! A mettre à jour !! (Accès dataset + affichage carto) Objectif : étudier la diversité spécifique et l'activité-densité des prédateurs (carabes) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles, avec 4 stations de piégeage par parcelle (2 pots par station); pièges ouverts pendant 4 jours à 2 périodes (mai et juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inra.fr/
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Conséquences de l’intensification agricole sur l’abondance de deux rapaces diurnes : la buse variable (Buteo buteo) et le faucon crécerelle (Falco tinnunculus) (Depuis 2004): Suivi par méthode IPA et IKA de l’abondance de deux espèces de rapaces diurnes dans 3 contextes paysagers contrastés ZAA et polders de la Baie du Mont st Michel Suivi IPA-IKA permanent tous les deux mois depuis décembre 2004 (suivi mensuel au cours de l’année 2005) Article de référence : -Butet, A., Michel, N., Rantier Y., Comor, V., Hubert-Moy, L., Nabucet, J., Delettre, Y. 2010. Responses of Common Buzzard (Buteo buteo) and Eurasian Kestrel (Falco tinnunculus) to land use changes in agricultural landscapes of Western France. Agriculture, Ecosystems and Environment, 138: 152-159. Programme : Programme national ANR-ECCO (CNRS INSU) « Dynamique des paysages et interactions proies-prédateurs (petits mammifères, rapaces). Conséquences de l’intensification agricole sur l’architecture des réseaux trophiques et les transferts de biomasse.
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Ce suivi a pour but d’analyser l’impact des facteurs abiotiques et de gestion agricole sur la structuration des communautés végétales de prairies humides. Protocole utilisé : 11 mailles paysagères de 500m de coté situées le long de la basse vallée du Couesnon. Au sein de la maille, choix de trois parcelles par mode de gestion (paturage, fauche, mixte). A l’intérieur de la parcelle, une zone tampon de 10m au sein de la parcelle est réalisée. Tous les habitats ont été échantillonnés au moins une fois, le nombre de relevés dépendant de leur abondance respective au sein de la parcelle. Un seul seul relevé en 2012. Les relevés floristiques sont réalisées selon la méthode de Braun-Blanquet
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"155 outils et méthodes d'observation de la biodiversité: base de données excel et résumé des fonctions de chaque outil (2017)" Cette base de données à été crée en 2017 par Ninon Chauvy lors de son stage de Licence Professionnelle intitulé "Outils et méthodes d'évaluation de la biodiversité à l'échelle de l'exploitation". Le stage de Ninon Chauvy a été encadré par Audrey Alignier (audrey.alignier@inra.fr) et Bénédicte Roche (benedicte.roche@inrae.fr) de l'UMR INRAE 0980 BAGAP. Le stage avait pour objectif de faire un état des lieux des outils et méthodes d'observaiton de la biodiversité. Ce stage s'inscrit dans le cadre du projet PEI-Agri 2017 "Favoriser l'autonomie des agriculteurs dans l'évaluation de la biodiversité sur leur exploitation".Ce projet est porté conjointement par la FRCIVAM (Hélène Roisille), Bretagne Vivante (Luc Guihard) et l'INRAE UMR 0980 BAGAP (Audrey Alignier et Bénédicte Roche).Ce projet a été soutenu par le Fonds européen agricole pour le développement rural – FEADER
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Quantification de la connectivité paysagère par test de repasse sur les passereaux communs de la métropole rennaise. Identification des espèces et réponse à la repasse de chant territorial. Dans le cadre de la thèse de Manon Balbi, projet Corbam.
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!! A mettre à jour !! (Accès dataset) "Relevés de carabes en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la diversité spécifique et l'activité-densité des prédateurs (carabes) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles, avec 4 stations de piégeage par parcelle (2 pots par station); pièges ouverts pendant 4 jours à 2 périodes (mai et juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; PREPARE; SEBIOPAG-STAR; STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/ Suivis réalisés en 2014, 2015, 2016, 2018, 2021 et 2023
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"Relevés floristiques dans les cultures et prairies de 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune, 2016" Protocole: Relevés floristiques exhaustifs réalisés le long de 2 transects de 50m de long, composés chacun de 5 lots de 2 quadrats de 1mx1m, positionnés l'un en bordure de parcelle (1er rang cultivé pour les céréales), l'autre au centre de la parcelle (à 25m du bord). 3 parcelles (1 en céréale, 1 en prairie de courte durée, 1 en prairie de longue durée) ont été échantillonnées par paysage. Projet de recherche: Seripage Site du projet: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE
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