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    Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.

  • Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) "Relevés de carabes aux interfaces entre parcelles cultivées et leurs bordures (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier les flux et l'activité-densité associée des carabes entre cultures de différente nature (céréales d'hiver et maïs) et avec leurs bordures (haies), réparties dans 15 interfaces de cultures au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles et leurs bordures par piégeage, avec 2 stations de piégeage par parcelle et 2 stations de piégeage par bordure de champs (2 pots par station) ; échantillonnage des flux de carabes aux interfaces entre parcelles et entre parcelles et leurs bordures avec des pièges à interception (4 pots par piège à interception) ; pièges ouverts en continu et relevés toutes les 2 semaines pendant 8 semaines au printemps et pendant 4 semaines à l'automne. Programme de financement : projet DIVA AGRICONNECT Martel, G., Aviron, S., Joannon, A., Lalechère, E., Roche, B., & Boussard, H. (2017). Impact of farming systems on agricultural landscapes and biodiversity: From plot to farm and landscape scales. European Journal of Agronomy.

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    Objectif : Cette tâche vise à étudier la dynamique de la végétation après exclusion de la pression de pâturage. Un exclos au sein de chaque communauté a été mis en place en 2007 pour les communautés mésophile, mésohygrophile et hygrophile et en 2011 dan la prairie à glycérie. Un exclos sera également mis en place en 2011 dans le prolongement de la rosière du secteur Nord pour permettre une extension de sa surface. Programme de recherche : Convention d'étude avec la communauté des communes de la baie du Mont St-Michel Coordinatrice : Cendrine Mony

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    Objectif : Estimer l’abondance relative de micromammifères et leur portage pour certains agents pathogènes transmis par les tiques dans la Zone Atelier Armorique dans le cadre du programme de recherche OSCAR (Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage Agricole du Risque acarologique – 2012-2015). Nature de la donnée : Série de cinq échantillonnages : -Mai-Juin 2012 -Octobre 2012 -Mai-Juin 2013 -Septembre-Octobre 2013 -Mai 2014 Protocole : Pose de 34 pièges INRA sur vingt-quatre lignes de 100 mètres placées dans différents types de paysage (forêt, lisière de forêt, bocage ouvert et dense le long de lisières de bois ou de haies) puis relevés à 24 et 48 heures. Les animaux piégés ont subi une prise de sang puis ont été sacrifiés pour réaliser par la suite des analyses moléculaires sur différent organes (détection de Borrelia burgdoreferi sl., Anaplasma phagocytophylum et Babesia microti). Référence protocole : Michel, N., F. Burel, and A. Butet. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes? Acta Oecologica 30:11–20. 10.1016/j.actao.2005.12.006 Pas d'article de référence. OSUR - UMR Ecobio 6553 université de Rennes 1-CNRS — UMR BioEpAR1300 Oniris-INRA

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) "Relevés de carabes en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la diversité spécifique et l'activité-densité des prédateurs (carabes) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles, avec 4 stations de piégeage par parcelle (2 pots par station); pièges ouverts pendant 4 jours à 2 périodes (mai et juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; PREPARE; SEBIOPAG-STAR; STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/ Suivis réalisés en 2014, 2015, 2016, 2018, 2021 et 2023

  • "Relevés floristiques des prairies de fonds de vallée de 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune, 2017" Protocole: La méthode consiste en un échantillonnage exhaustif de la végétation vasculaire des parcelles de prairies de fond de vallée, au niveau de 20 quadrats de 1m² (1m x 1m) disposés de part et d'autre de 5 transects équidistants (transversaux par rapport au cours d'eau). Dix quadrats sont positionnés de part et d'autre de chacun de ces transects à 1m du bord de la parcelle (côté Sélune) , on les appellera "quadrats de bord". Les dix autres sont également positionnés de part et d'autre de chacun des transects, mais à une distance à la bordure égale à la moitié de la longueur des transects. On les appellera "quadrats de centre". A chaque espèce identifiée est attribué un coefficient d'abondance-dominance d'après l'échelle de Braun Blanquet. Projet de recherche: Seripage Site du projet: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE

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    28 parcelles de prairies temporaires d'âge 6 ou 7 ans (occupation du sol en cultures avant); Parcelles gérées par pâturage et (éventuellement fauche ponctuellement) Au sein de chaque parcelle, 10 relevés floristiques ont été réalisés selon un plan d'échantillonnage systématique et localisés à plus de 20m des bordures. (relevés de banques de graines effectués au sein des mêmes relevés -> cf fiche banque de graines) Chaque relevé est réalisé en juin 2016 au sein d'un carré de 5mx5m en % de recouvrement par rapport au sol Toutes les espèces végétales ont été identifiées

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    Comprendre la réponse des communautés végétales à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : La caractérisation des communautés végétales des bois a été faite à partir de relevés réalisés dans six quadrats de 14mx5m, selon un échantillonnage systématique dans chaque bois afin de prendre en compte leur éventuelle hétérogénéité. Trois sont placés le long de la lisière et trois en cœur, afin de mettre en évidence un éventuel « effet lisière ». La lisière a été définie à partir des premiers arbres (DBH>10 cm) et le cœur est la zone centrale du bois, à partir de 25m à la lisière, les principaux effets de lisière s’opérant dans les 20 premiers mètres à la bordure. La forme allongée des quadrats permet de prendre en compte l’hétérogénéité le long des lisières. L’échantillonnage couvre donc une surface de 210m2 en lisière et en cœur et 420m2 dans tout le bois, ce qui est en accord avec l’aire minimale requise pour caractériser les communautés végétales forestières (100 à 400 m2). Les pourcentages de recouvrement des plantes herbacées, arbustives et des arbres (canopée) ont été relevés dans chaque quadrat. Compte-tenu de l’emploi du temps, un seul passage a été effectué, à la fin du mois de juin afin d’augmenter les chances de capter à la fois les espèces précoces et les espèces tardives. Les relevés ont été réalisés en Juin 2012 Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.

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    Conséquences de l’intensification agricole sur l’abondance de deux rapaces diurnes : la buse variable (Buteo buteo) et le faucon crécerelle (Falco tinnunculus) (Depuis 2004): Suivi par méthode IPA et IKA de l’abondance de deux espèces de rapaces diurnes dans 3 contextes paysagers contrastés ZAA et polders de la Baie du Mont st Michel Suivi IPA-IKA permanent tous les deux mois depuis décembre 2004 (suivi mensuel au cours de l’année 2005) Article de référence : -Butet, A., Michel, N., Rantier Y., Comor, V., Hubert-Moy, L., Nabucet, J., Delettre, Y. 2010. Responses of Common Buzzard (Buteo buteo) and Eurasian Kestrel (Falco tinnunculus) to land use changes in agricultural landscapes of Western France. Agriculture, Ecosystems and Environment, 138: 152-159. Programme : Programme national ANR-ECCO (CNRS INSU) « Dynamique des paysages et interactions proies-prédateurs (petits mammifères, rapaces). Conséquences de l’intensification agricole sur l’architecture des réseaux trophiques et les transferts de biomasse.