Communautés de prédateurs (carabes et araignées) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de prédateurs (carabes et araignées) Protocole : Échantillonnage par pièges à fosse (Barber) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Bertrand, C., Burel, F., & Baudry, J. (2016). Spatial and temporal heterogeneity of the crop mosaic influences carabid beetles in agricultural landscapes. Landscape Ecology, 31(2), 451-466. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

!! A mettre à jour !! (Accès dataset) Effet de l’hétérogénéité paysagère, et en particulier de l’hétérogénéité de la mosaïque agricole, sur la diversité des cultures : le cas des carabes. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille, 2 parcelles de maïs et 2 parcelles de céréale d’hiver (le plus souvent du blé)ont été échantillonnés (soit 4 parcelles par maille au total)Plusieurs sessions de piégeage ont eu lieu entre mai et septembre 2012. Protocole : 2 points d’échantillonnage par parcelles, 2 pièges Barber par point d’échantillonnage,4 périodes d’échantillonnage pour les céréales d’hiver au printemps, 7 périodes d’échantillonnage pour le maïs (4 au printemps et 3 en fin d’été). Les périodes d’échantillonnage correspondent à une ouverture des pièges pendant 1 semaine. Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf :Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity as an ecological filter of species traits. Acta Oecologica, 56: 19-26.

!! A mettre à jour !! (Accès dataset) Objectif : étudier la hauteur du couvert au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : mesurer la hauteur du couvert dans 4 stations de piégeages de chaque parcelle. Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inrae.fr/

!! A mettre à jour !! (Accès carto + dataset) Analyse des effets du contexte paysager et des parcelles adjacentes sur les communautés de coléoptères carabiques des haies, dans trois paysages bocagers de structure contrastée. Protocole : piégeage d’insectes par pots barber Une publication : Aviron, S., F. Burel, et al. (2005). "Carabid assemblages in agricultural landscapes: impacts of habitat features, landscape context at different spatial scales and farming intensity." Agriculture Ecosystems and Environment108(3): 205-217. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1') Financé par le ministère de l'écologie

"Relevés floristiques sur les 3 mini-réseaux (A, B et C) de la Zone Atelier de Pleine-fougères suivant un référentiel de 42 espèces" Relevés en présence/absence de 42 espèces floristiques (espèces du référentiel Ecobordure) dans les bords de champs des 3 mini-réseaux bocagers de Pleine-fougères Protocole: transect de 25m placé au niveau d'un tronçon homogène du bord de champ

Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

Objectif : Estimer l’abondance relative de micromammifères et leur portage pour certains agents pathogènes transmis par les tiques dans la Zone Atelier Armorique dans le cadre du programme de recherche OSCAR (Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage Agricole du Risque acarologique – 2012-2015). Nature de la donnée : Série de cinq échantillonnages : -Mai-Juin 2012 -Octobre 2012 -Mai-Juin 2013 -Septembre-Octobre 2013 -Mai 2014 Protocole : Pose de 34 pièges INRA sur vingt-quatre lignes de 100 mètres placées dans différents types de paysage (forêt, lisière de forêt, bocage ouvert et dense le long de lisières de bois ou de haies) puis relevés à 24 et 48 heures. Les animaux piégés ont subi une prise de sang puis ont été sacrifiés pour réaliser par la suite des analyses moléculaires sur différent organes (détection de Borrelia burgdoreferi sl., Anaplasma phagocytophylum et Babesia microti). Référence protocole : Michel, N., F. Burel, and A. Butet. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes? Acta Oecologica 30:11–20. 10.1016/j.actao.2005.12.006 Pas d'article de référence. OSUR - UMR Ecobio 6553 université de Rennes 1-CNRS — UMR BioEpAR1300 Oniris-INRA

Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de contrôle biologique des ravageurs de culture Protocole : Installation de cartes sur lesquelles des pucerons sont offerts à la prédation le long de 2 transects en centre de parcelle puis comptage du nombre de pucerons prédatés après 24h Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland