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    Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

  • Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".

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    Communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) Protocole : Echantillonnage par coupelles colorées (Pan Traps) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Hass, A. L., Kormann, U. G., Tscharntke, T., Clough, Y., Baillod, A. B., Sirami, C., ... & Batáry, P. (2018). Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in western Europe. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 285(1872), 20172242. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

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    Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

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    Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de contrôle biologique des ravageurs de culture Protocole : Installation de cartes sur lesquelles des pucerons sont offerts à la prédation le long de 2 transects en centre de parcelle puis comptage du nombre de pucerons prédatés après 24h Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

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    Etude du role des bandes enherbées sur le maintien de la biodiversité au sein des paysages agricoles. Cette étude a été réalisée dans le cadre d’un projet financé par la région Bretagne. Le protocole consistait à réaliser 3 transects au sein de la bande enherbée. Chaque transect est séparé de 50m Pour chaque transect, 4 quadrats de 2m*0.5m ont été effectués. Q1 : relevé dans la haie ou bordure Q2 : relevé à 5à cm de la bordure Q3 : centre de la BE Q4 : à 50 cm de la parcelle L’abondance-dominance de chaque espèce a été mesurée à l’aide des coefficients de Braun Blanquet. 47 bandes suivies : 46 en 2006, 53 en 2007 et 34 en 2008.. Article ref : Ernoult A, Vialatte A, Butet A, Michel N, Rantier Y, Jambon O, Burel F (2013). Grassy strips in their landscape context, their role as new habitat for biodiversity, Agriculture, Ecosystems & Environment, 166: 15-27 Programme de recherché : Projet SIE financement région Bretagne

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    Objectif : Cette opération consiste à suivre les effectifs de cette espèce au cours du temps et de lier la dynamique observée avec les actions menées. Programme de recherche : Convention d'étude avec la communauté des communes de la baie du Mont St-Michel Coordinatrice : Cendrine Mony

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset et carto) Suivi de communautés de carabes dans les mini-réseaux de haies dans 3 paysages contrastés aux alentours de Pleine-Fougères. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1')

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    Comprendre la réponse des communautés végétales à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : La caractérisation des communautés végétales des bois a été faite à partir de relevés réalisés dans six quadrats de 14mx5m, selon un échantillonnage systématique dans chaque bois afin de prendre en compte leur éventuelle hétérogénéité. Trois sont placés le long de la lisière et trois en cœur, afin de mettre en évidence un éventuel « effet lisière ». La lisière a été définie à partir des premiers arbres (DBH>10 cm) et le cœur est la zone centrale du bois, à partir de 25m à la lisière, les principaux effets de lisière s’opérant dans les 20 premiers mètres à la bordure. La forme allongée des quadrats permet de prendre en compte l’hétérogénéité le long des lisières. L’échantillonnage couvre donc une surface de 210m2 en lisière et en cœur et 420m2 dans tout le bois, ce qui est en accord avec l’aire minimale requise pour caractériser les communautés végétales forestières (100 à 400 m2). Les pourcentages de recouvrement des plantes herbacées, arbustives et des arbres (canopée) ont été relevés dans chaque quadrat. Compte-tenu de l’emploi du temps, un seul passage a été effectué, à la fin du mois de juin afin d’augmenter les chances de capter à la fois les espèces précoces et les espèces tardives. Les relevés ont été réalisés en Juin 2012 Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) "Relevés de carabes en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la diversité spécifique et l'activité-densité des prédateurs (carabes) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles, avec 4 stations de piégeage par parcelle (2 pots par station); pièges ouverts pendant 4 jours à 2 périodes (mai et juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; PREPARE; SEBIOPAG-STAR; STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/ Suivis réalisés en 2014, 2015, 2016, 2018, 2021 et 2023