Communautés de prédateurs (carabes et araignées) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de prédateurs (carabes et araignées) Protocole : Échantillonnage par pièges à fosse (Barber) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Bertrand, C., Burel, F., & Baudry, J. (2016). Spatial and temporal heterogeneity of the crop mosaic influences carabid beetles in agricultural landscapes. Landscape Ecology, 31(2), 451-466. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Comprendre la réponse des communautés d’oiseaux à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : Protocole : Le plan d’échantillonnage de la communauté d’oiseaux nicheurs a été basé sur la méthode STOC-EPS (Suivi Temporel des Oiseaux Communs par Echantillonnages Ponctuels Simples). Cet échantillonnage prévoit trois passages afin de couvrir la phénologie des oiseaux forestiers : un passage début avril pour capter les nicheurs précoces et deux passages en mai et juin pour les nicheurs tardifs et espèces migratrices. L’échantillonnage consiste en la réalisation de points d’écoute : afin d’optimiser les contacts, l’observateur écoute les chants et cris d’oiseaux pendant 5 minutes en étant placé au centre de la zone étudiée, ici du bois. L’objectif étant d’être le plus exhaustif possible, 5 minutes d’écoute ont été rajoutées afin d’augmenter les chances d’entendre l’ensemble des espèces présentes. L’étude étant focalisée sur les espèces forestières, seuls les individus nichant dans les bois ont été retenus. Les relevés ont été réalisés entre Avril et Juin 2012 Article de référence : Gil Tena,A., Lecerf, R., Ernoult A. (2013). Disentangling community assemblages to depict an indicator of biological connectivity: a regional study of fragmented semi-natural grasslands. Ecological Indicators, 24: 48-55. Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.

!! A mettre à jour !! (Accès carto + dataset) Analyse des effets du contexte paysager et des parcelles adjacentes sur les communautés de coléoptères carabiques des haies, dans trois paysages bocagers de structure contrastée. Protocole : piégeage d’insectes par pots barber Une publication : Aviron, S., F. Burel, et al. (2005). "Carabid assemblages in agricultural landscapes: impacts of habitat features, landscape context at different spatial scales and farming intensity." Agriculture Ecosystems and Environment108(3): 205-217. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1') Financé par le ministère de l'écologie

Comprendre la réponse des communautés végétales à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : La caractérisation des communautés végétales des bois a été faite à partir de relevés réalisés dans six quadrats de 14mx5m, selon un échantillonnage systématique dans chaque bois afin de prendre en compte leur éventuelle hétérogénéité. Trois sont placés le long de la lisière et trois en cœur, afin de mettre en évidence un éventuel « effet lisière ». La lisière a été définie à partir des premiers arbres (DBH>10 cm) et le cœur est la zone centrale du bois, à partir de 25m à la lisière, les principaux effets de lisière s’opérant dans les 20 premiers mètres à la bordure. La forme allongée des quadrats permet de prendre en compte l’hétérogénéité le long des lisières. L’échantillonnage couvre donc une surface de 210m2 en lisière et en cœur et 420m2 dans tout le bois, ce qui est en accord avec l’aire minimale requise pour caractériser les communautés végétales forestières (100 à 400 m2). Les pourcentages de recouvrement des plantes herbacées, arbustives et des arbres (canopée) ont été relevés dans chaque quadrat. Compte-tenu de l’emploi du temps, un seul passage a été effectué, à la fin du mois de juin afin d’augmenter les chances de capter à la fois les espèces précoces et les espèces tardives. Les relevés ont été réalisés en Juin 2012 Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.

Communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) Protocole : Echantillonnage par coupelles colorées (Pan Traps) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Hass, A. L., Kormann, U. G., Tscharntke, T., Clough, Y., Baillod, A. B., Sirami, C., ... & Batáry, P. (2018). Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in western Europe. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 285(1872), 20172242. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

"Relevés floristiques sur les 3 mini-réseaux (A, B et C) de la Zone Atelier de Pleine-fougères suivant un référentiel de 42 espèces" Relevés en présence/absence de 42 espèces floristiques (espèces du référentiel Ecobordure) dans les bords de champs des 3 mini-réseaux bocagers de Pleine-fougères Protocole: transect de 25m placé au niveau d'un tronçon homogène du bord de champ

!! A mettre à jour !! (Accès dataset et carto) Suivi de communautés de carabes dans les mini-réseaux de haies dans 3 paysages contrastés aux alentours de Pleine-Fougères. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1')

"Relevés de la structure des bordures des champs sur les 3 mini-réseaux (A, B et C) de la ZAAr, 2015" Relevés de la structure des bordures de champs sur les 3 mini-réseaux (site A, B et C) de la Zone Atelier Armorique. Les variables mesurées sont la largeur de la bordure, la longueur de la bordure, la présence ou non de talus, la hauteur de talus, la présence ou non de fossé, la profondeur du fossé, la présence ou non de clôture, la localisation de la clôture. En parallèle, sur un échantillon de bordure, c'est-à-dire sur un tronçon de 25m de long représentatif de la physionomie générale de la bordure: 1) caractérisation de la structure verticale de la bordure: observation de la présence ou non de strate arbustive (si oui, évaluation en % de l'échantillon de bordure), présence ou non de strate arborée (si oui, évaluation en % de la longueur de l'échantillon de bordure + mesure de la hauteur dominante de la canopée + mesure de la largeur de la canopée), 2) notation des espèces arbustives dominantes, notation des espèces arborées dominantes, 3) estimation du % sol nu, du % de litière, du % de rocher sur la longueur de l'échantillon de bordure. Valorisation: Alignier A. (2018) Changes in a field margin vegetation metacommunity over a 21-year interval and the impacts of structural condition and management. Agriculture, Ecosystems and Environment, 251, 1-10

Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)