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Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.
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Suivi de carabes dans les haies (Pleine-Fougères, secteur A, 2007-...) - Zone Atelier Armorique ZAAr
"Suivi des communautés de carabes des haies du mini réseau A, ZAAr (2007-)" Ce suivi s'inscrit dans le suivi des communauté de carabes des haies des mini-réseaux de la Zone Atelier Armorique (site de Pleine-fougères). Dans le mini-réseau B, 10 haies ont été choisies en fonction de leur structure (strate arborescente, strate arbustive, talus, fossé...). Dans chaque haie sont positionnés 3 pot-barbers écartés de 1 à 2 m de distance. Ces pots-pièges sont positionnés au milieu de la haie. Pour chaque année d'étude, les pièges sont ouverts en continu, de fin avril à début octobre, par session de 15 jours. Ce suivi est effectué tous les 2 ans: 2007, 2009, 2011, 2013, 2015, 2017, 2019.
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Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de plantes Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Alignier, A., Solé‐Senan, X. O., Robleño, I., Baraibar, B., Fahrig, L., Giralt, D., ... & Batáry, P. (2020). Configurational crop heterogeneity increases within‐field plant diversity. Journal of Applied Ecology, 57(4), 654-663. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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Classification obtenue à partir d'une image LANDSAT datée du 25-05-2014 dans le cadre du projet SERIPAGE
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Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".
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!! A mettre à jour !! (Accès jeu de données) "Relevés de flore en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la flore au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - Dix quadrats de 50 * 50 cm, positionnés tous les 3 mètres sur une bande située à 50m de la bordure de la parcelle (cf. schéma ci-dessous). Pour chacun noter : - le % de recouvrement pour : adventices total, graminées, dicotylédones, espèce dominante, espèces en montaison (attention graminées, fleurs discrètes) - le nombre d’espèces total, graminées, dicotylédones. Ces suivis ont été effectués en 2014, 2015, 2018, 2021 et 2023 Programmes de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; projet PREPARE; projet STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/
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"Relevés floristiques des prairies de fonds de vallée de 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune, 2017" Protocole: La méthode consiste en un échantillonnage exhaustif de la végétation vasculaire des parcelles de prairies de fond de vallée, au niveau de 20 quadrats de 1m² (1m x 1m) disposés de part et d'autre de 5 transects équidistants (transversaux par rapport au cours d'eau). Dix quadrats sont positionnés de part et d'autre de chacun de ces transects à 1m du bord de la parcelle (côté Sélune) , on les appellera "quadrats de bord". Les dix autres sont également positionnés de part et d'autre de chacun des transects, mais à une distance à la bordure égale à la moitié de la longueur des transects. On les appellera "quadrats de centre". A chaque espèce identifiée est attribué un coefficient d'abondance-dominance d'après l'échelle de Braun Blanquet. Projet de recherche: Seripage Site du projet: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE
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Communautés de prédateurs (carabes et araignées) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de prédateurs (carabes et araignées) Protocole : Échantillonnage par pièges à fosse (Barber) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Bertrand, C., Burel, F., & Baudry, J. (2016). Spatial and temporal heterogeneity of the crop mosaic influences carabid beetles in agricultural landscapes. Landscape Ecology, 31(2), 451-466. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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!! A mettre à jour !! (Accès dataset) Objectif : étudier l'intensité de la prédation de proies sentinelles (pucerons, graines d'adventices et oeufs) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage de la prédation par exposition de cartes contenant des proies sentinelles (3 pucerons, ou 10 graines d'adventices ou un paquet d'oeufs d'insectes), les cartes étant installés en 10 points répartis sur 2 transects parallèles (transects à 15m de la bordure de parcelle, 10m entre transects, 12m entre points) ; exposition des cartes pendant 24h pour les pucerons et 4 jours pour les graines et les œufs, à 2 périodes (début mai, début juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inrae.fr/ Suivis réalisés en 2014, 2015, 2016, 2018, 2021 et 2023