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Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.
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"Relevés floristiques des prairies de fonds de vallée de 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune, 2017" Protocole: La méthode consiste en un échantillonnage exhaustif de la végétation vasculaire des parcelles de prairies de fond de vallée, au niveau de 20 quadrats de 1m² (1m x 1m) disposés de part et d'autre de 5 transects équidistants (transversaux par rapport au cours d'eau). Dix quadrats sont positionnés de part et d'autre de chacun de ces transects à 1m du bord de la parcelle (côté Sélune) , on les appellera "quadrats de bord". Les dix autres sont également positionnés de part et d'autre de chacun des transects, mais à une distance à la bordure égale à la moitié de la longueur des transects. On les appellera "quadrats de centre". A chaque espèce identifiée est attribué un coefficient d'abondance-dominance d'après l'échelle de Braun Blanquet. Projet de recherche: Seripage Site du projet: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE
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"Relevés floristiques en bordures de champs suivant un référentiel de 31 espèces dans 9 paysages agricoles distribués le long du fleuve Sélune, 2016" Relevés floristiques suivant un référentiel de 31 espèces (espèces du référentiel Ecobordure) sur une vingtaine de bordures de champs dans 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune. Projet de recherche: Seripage Site du projet de recherche: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE
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!! A mettre à jour !! (Accès dataset) Caractérisation de la diversité gamma des plantes du nord de l’ille et vilaine (2011): Effet de l’hétérogénéité paysagère sur la diversité gamma : le cas de la végétation. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille : 5 habitats échantillonnés : les bois, les prairies permanentes, les prairies temporaires, les cultures et les haies. Pour mesurer la diversité gamma, 2 réplicats de chaque habitat ont été choisis : 10 relevés par maille. Pour chaque habitat 3 quadrats sont effectués Pour les prairies et les cultures, les quadrats sont de 2m*2m positionnés à 2, 6, et 10m de la bordure (Q1, Q2, Q3 respectivement). Pour les bois, les quadrats sont de 5m*5m et séparés d’une distance de 5m (de la bordure vers le centre : Q1, Q2, Q3). Les haies sont échantillonnées par 3 quadrats de 5m*2m séparés de 5m chacun. Les relevés ont été réalisés entre Mai et Aout 2011 Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf : Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity
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!! A mettre à jour !! (Accès dataset + affichage carto) Objectif : étudier la diversité spécifique et l'activité-densité des prédateurs (carabes) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles, avec 4 stations de piégeage par parcelle (2 pots par station); pièges ouverts pendant 4 jours à 2 périodes (mai et juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inra.fr/
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Suivi de carabes dans les haies (Pleine-Fougères, secteur B, 2007-...) - Zone Atelier Armorique ZAAr
"Suivi de la communauté de carabes des haies (mini réseau B) - ZAAr" Ce suivi s'inscrit dans le suivi des communauté de carabes des haies des mini-réseaux de la Zone Atelier Armorique (site de Pleine-fougères). Dans le mini-réseau B, 10 haies ont été choisies en fonction de leur structure (strate arborescente, strate arbustive, talus, fossé...). Dans chaque haie sont positionnés 3 pot-barbers écartés de 1 à 2 m de distance. Ces pots-pièges sont positionnés au milieu de la haie. Pour chaque année d'étude, les pièges sont ouverts en continu, de fin avril à début octobre, par session de 15 jours. Ce suivi est effectué tous les 2 ans: 2007, 2009, 2011, 2013, 2015, 2017, 2019.
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Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés d’oiseaux Protocole : IPA de 10 min réalisés en bordure de parcelles agricoles Article de référence : à venir Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de contrôle biologique des ravageurs de culture Protocole : Installation de cartes sur lesquelles des pucerons sont offerts à la prédation le long de 2 transects en centre de parcelle puis comptage du nombre de pucerons prédatés après 24h Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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"155 outils et méthodes d'observation de la biodiversité: base de données excel et résumé des fonctions de chaque outil (2017)" Cette base de données à été crée en 2017 par Ninon Chauvy lors de son stage de Licence Professionnelle intitulé "Outils et méthodes d'évaluation de la biodiversité à l'échelle de l'exploitation". Le stage de Ninon Chauvy a été encadré par Audrey Alignier (audrey.alignier@inra.fr) et Bénédicte Roche (benedicte.roche@inrae.fr) de l'UMR INRAE 0980 BAGAP. Le stage avait pour objectif de faire un état des lieux des outils et méthodes d'observaiton de la biodiversité. Ce stage s'inscrit dans le cadre du projet PEI-Agri 2017 "Favoriser l'autonomie des agriculteurs dans l'évaluation de la biodiversité sur leur exploitation".Ce projet est porté conjointement par la FRCIVAM (Hélène Roisille), Bretagne Vivante (Luc Guihard) et l'INRAE UMR 0980 BAGAP (Audrey Alignier et Bénédicte Roche).Ce projet a été soutenu par le Fonds européen agricole pour le développement rural – FEADER
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Effets de l’évolution des paysages agricoles sur les communautés de carabes et de petits mammifères (1998-1999): Etude de la diversité et de l’abondance des communautés de petits mammifères et de carabes dans 11 contextes paysagers en Bretagne. Carabes échantillonnés de mai à juillet 1998. Les collectes ont été réalisées sur 11 sites de 1km2, 10 haies avec 3 pot-pièges dans chaque haie. Petits mammifères : Etude indirecte par analyse de pelotes de rapaces. 4 sessions de collecte de pelotes d’effraie de sept 1998 à Oct 1999. Articles de références : -Millán-Peña, N., Butet A., Delettre, Y., Morant, P. & Burel, F. 2003. Landscape context and carabid beetles (Coleoptera: Carabidae) communities of hedgerows in western France. Agriculture, Ecosystems and Environments, 94 : 59-72. -Millán-Peña, N. , Butet, A., Delettre, Y., Paillat, G., Morant, P., Le Du, L. and F. Burel. 2003. Response of the small mammal community to changes in western French agricultural landscapes. Landscape Ecology, 18 : 265 - 278. -Burel, F., Butet, A. Delettre, Y.R. and Millàn de la Peña, N. 2004. Differential response of selected taxa to landscape context and agricultural intensification. Landscape and Urban Planning, 67 : 195 - 204. Programme de recherche : Le Du, L., Morant, P., Burel, F. Butet, A.., Millan, N., Rantier Y. Wolff, A., Rozé, F. Saliou, P. Baudry, J. Volant, D. 2000. Cartographie et évaluation de la qualité biologique du bocage du département des côtes d’Armor. Plan départemental pour l’Environnement Action 15-1 Amélioration des connaissances du bocage 2 volumes, 200 p. (RAPPORT)