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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) Objectif : étudier l'intensité de la prédation de proies sentinelles (pucerons, graines d'adventices et oeufs) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage de la prédation par exposition de cartes contenant des proies sentinelles (3 pucerons, ou 10 graines d'adventices ou un paquet d'oeufs d'insectes), les cartes étant installés en 10 points répartis sur 2 transects parallèles (transects à 15m de la bordure de parcelle, 10m entre transects, 12m entre points) ; exposition des cartes pendant 24h pour les pucerons et 4 jours pour les graines et les œufs, à 2 périodes (début mai, début juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inrae.fr/ Suivis réalisés en 2014, 2015, 2016, 2018, 2021 et 2023

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    Objectif: Impact de l'urbanisation des terres sur les communautés de coléoptères carabidés de boisements. Méthodes: Échantillonnage des communautés (mai-juillet) de coléoptères carabidés dans 19 sites répartis le long d’un gradient rural-urbain (Rennes et sa périphérie). Série temporelle pour les coléoptères.

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) "Relevés de carabes aux interfaces entre parcelles cultivées et leurs bordures (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier les flux et l'activité-densité associée des carabes entre cultures de différente nature (céréales d'hiver et maïs) et avec leurs bordures (haies), réparties dans 15 interfaces de cultures au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles et leurs bordures par piégeage, avec 2 stations de piégeage par parcelle et 2 stations de piégeage par bordure de champs (2 pots par station) ; échantillonnage des flux de carabes aux interfaces entre parcelles et entre parcelles et leurs bordures avec des pièges à interception (4 pots par piège à interception) ; pièges ouverts en continu et relevés toutes les 2 semaines pendant 8 semaines au printemps et pendant 4 semaines à l'automne. Programme de financement : projet DIVA AGRICONNECT Martel, G., Aviron, S., Joannon, A., Lalechère, E., Roche, B., & Boussard, H. (2017). Impact of farming systems on agricultural landscapes and biodiversity: From plot to farm and landscape scales. European Journal of Agronomy.

  • "Relevés floristiques en bordures de champs suivant un référentiel de 31 espèces dans 9 paysages agricoles distribués le long du fleuve Sélune, 2016" Relevés floristiques suivant un référentiel de 31 espèces (espèces du référentiel Ecobordure) sur une vingtaine de bordures de champs dans 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune. Projet de recherche: Seripage Site du projet de recherche: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE

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    Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

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    Comprendre la réponse des communautés végétales à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : La caractérisation des communautés végétales des bois a été faite à partir de relevés réalisés dans six quadrats de 14mx5m, selon un échantillonnage systématique dans chaque bois afin de prendre en compte leur éventuelle hétérogénéité. Trois sont placés le long de la lisière et trois en cœur, afin de mettre en évidence un éventuel « effet lisière ». La lisière a été définie à partir des premiers arbres (DBH>10 cm) et le cœur est la zone centrale du bois, à partir de 25m à la lisière, les principaux effets de lisière s’opérant dans les 20 premiers mètres à la bordure. La forme allongée des quadrats permet de prendre en compte l’hétérogénéité le long des lisières. L’échantillonnage couvre donc une surface de 210m2 en lisière et en cœur et 420m2 dans tout le bois, ce qui est en accord avec l’aire minimale requise pour caractériser les communautés végétales forestières (100 à 400 m2). Les pourcentages de recouvrement des plantes herbacées, arbustives et des arbres (canopée) ont été relevés dans chaque quadrat. Compte-tenu de l’emploi du temps, un seul passage a été effectué, à la fin du mois de juin afin d’augmenter les chances de capter à la fois les espèces précoces et les espèces tardives. Les relevés ont été réalisés en Juin 2012 Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.

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    Communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) Protocole : Echantillonnage par coupelles colorées (Pan Traps) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Hass, A. L., Kormann, U. G., Tscharntke, T., Clough, Y., Baillod, A. B., Sirami, C., ... & Batáry, P. (2018). Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in western Europe. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 285(1872), 20172242. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

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    Ce suivi a pour but d’analyser l’impact des facteurs abiotiques et de gestion agricole sur la structuration des communautés végétales de prairies humides. Protocole utilisé : 11 mailles paysagères de 500m de coté situées le long de la basse vallée du Couesnon. Au sein de la maille, choix de trois parcelles par mode de gestion (paturage, fauche, mixte). A l’intérieur de la parcelle, une zone tampon de 10m au sein de la parcelle est réalisée. Tous les habitats ont été échantillonnés au moins une fois, le nombre de relevés dépendant de leur abondance respective au sein de la parcelle. Un seul seul relevé en 2012. Les relevés floristiques sont réalisées selon la méthode de Braun-Blanquet

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) Caractérisation de la diversité gamma des plantes du nord de l’ille et vilaine (2011): Effet de l’hétérogénéité paysagère sur la diversité gamma : le cas de la végétation. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille : 5 habitats échantillonnés : les bois, les prairies permanentes, les prairies temporaires, les cultures et les haies. Pour mesurer la diversité gamma, 2 réplicats de chaque habitat ont été choisis : 10 relevés par maille. Pour chaque habitat 3 quadrats sont effectués Pour les prairies et les cultures, les quadrats sont de 2m*2m positionnés à 2, 6, et 10m de la bordure (Q1, Q2, Q3 respectivement). Pour les bois, les quadrats sont de 5m*5m et séparés d’une distance de 5m (de la bordure vers le centre : Q1, Q2, Q3). Les haies sont échantillonnées par 3 quadrats de 5m*2m séparés de 5m chacun. Les relevés ont été réalisés entre Mai et Aout 2011 Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf : Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity

  • Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".