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  • Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".

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    !! A mettre à jour !! (Accès jeu de données) "Relevés de flore en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la flore au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - Dix quadrats de 50 * 50 cm, positionnés tous les 3 mètres sur une bande située à 50m de la bordure de la parcelle (cf. schéma ci-dessous). Pour chacun noter : - le % de recouvrement pour : adventices total, graminées, dicotylédones, espèce dominante, espèces en montaison (attention graminées, fleurs discrètes) - le nombre d’espèces total, graminées, dicotylédones. Ces suivis ont été effectués en 2014, 2015, 2018, 2021 et 2023 Programmes de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; projet PREPARE; projet STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/

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    "Relevés floristiques sur les 3 mini-réseaux (A, B et C) de la Zone Atelier de Pleine-fougères suivant un référentiel de 42 espèces" Relevés en présence/absence de 42 espèces floristiques (espèces du référentiel Ecobordure) dans les bords de champs des 3 mini-réseaux bocagers de Pleine-fougères Protocole: transect de 25m placé au niveau d'un tronçon homogène du bord de champ

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    Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

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    "155 outils et méthodes d'observation de la biodiversité: base de données excel et résumé des fonctions de chaque outil (2017)" Cette base de données à été crée en 2017 par Ninon Chauvy lors de son stage de Licence Professionnelle intitulé "Outils et méthodes d'évaluation de la biodiversité à l'échelle de l'exploitation". Le stage de Ninon Chauvy a été encadré par Audrey Alignier (audrey.alignier@inra.fr) et Bénédicte Roche (benedicte.roche@inrae.fr) de l'UMR INRAE 0980 BAGAP. Le stage avait pour objectif de faire un état des lieux des outils et méthodes d'observaiton de la biodiversité. Ce stage s'inscrit dans le cadre du projet PEI-Agri 2017 "Favoriser l'autonomie des agriculteurs dans l'évaluation de la biodiversité sur leur exploitation".Ce projet est porté conjointement par la FRCIVAM (Hélène Roisille), Bretagne Vivante (Luc Guihard) et l'INRAE UMR 0980 BAGAP (Audrey Alignier et Bénédicte Roche).Ce projet a été soutenu par le Fonds européen agricole pour le développement rural – FEADER

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    Le jeu de données comprend la vitesse de décomposition en milieux aquatique, terrestre humide et terrestre sec dans la forêt de Villecartier pour 18 espèces d'arbres (..........................................). Les caractéristiques chimiques (composition élémentaire C,N,P; teneur en phénol/polyphénol, cellulose, hémicellulose, métaboliques secondaires, terpènes, micronutriments) ainsi que leurs caractéristiques physiques (dureté, épaisseur, SLA, capacités de retention en eau) ont également été mesurées. De plus, la colonisation par les invertébrés et la biomasse microbienne (par mesure de respiration par la méthode SIR) ont été mesurées dans chaque milieux et pour chaque type de feuille. Des données sur les communautés d'invertébrés et les conditions climatiques (température, hygrométrie) des sites sont également disponibles

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) "Relevés de carabes en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la diversité spécifique et l'activité-densité des prédateurs (carabes) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles, avec 4 stations de piégeage par parcelle (2 pots par station); pièges ouverts pendant 4 jours à 2 périodes (mai et juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; PREPARE; SEBIOPAG-STAR; STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/ Suivis réalisés en 2014, 2015, 2016, 2018, 2021 et 2023

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    Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) Objectif : étudier la diversité spécifique et l'activité-densité des prédateurs (araignées) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles, avec 4 stations de piégeage par parcelle (2 pots par station); pièges ouverts pendant 4 jours à 2 périodes (mai et juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inrae.fr/ Suivis réalisés en 2014 et 2023

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    Objectif : Ce suivi a pour objectif d'analyser la dynamique végétale après semis des bandes enherbées expérimentales. Le semis a été réalisé en 2010 Sur les BE, les relevés floristiques ont été effectués en juin 2010, 3 mois après semis. Les quadrats utilisés sont de 2x2 m, positionnés à 3m du bord de la bande enherbée selon 10 points dans le sens de la longueur. Le pourcentage de recouvrement par rapport au sol des différentes espèces en présence a été évalué à l'estime avec une précision de 5%. Projet : ANR MODECOL Programme de recherche : Système Complexe et Modèlisation de l'ANR Coordinatrice : Cendrine Mony