Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.

Relevés exhaustifs de la flore des bords de champs des 3 mini-réseaux bocagers de la Zone Atelier Armorique à Pleine-Fougères. Protocole: placé le long d'une haie, sur un tronçon homogène; coefficient d'abondance-dominance des espèces (dans certains cas transect de 25m sur la longueur ou sur la totalité de la haie).

!! A mettre à jour !! (Accès carto + dataset) Analyse des effets du contexte paysager et des parcelles adjacentes sur les communautés de coléoptères carabiques des haies, dans trois paysages bocagers de structure contrastée. Protocole : piégeage d’insectes par pots barber Une publication : Aviron, S., F. Burel, et al. (2005). "Carabid assemblages in agricultural landscapes: impacts of habitat features, landscape context at different spatial scales and farming intensity." Agriculture Ecosystems and Environment108(3): 205-217. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1') Financé par le ministère de l'écologie

!! A mettre à jour !! (Accès au dataset et à la carto) "Diversité gamma des carabes (Nord Ille et Vilaine, 2011) Zone Atelier Armorique ZAAr" Caractérisation de la diversité gamma des carabes du Nord de l’Ille et Vilaine (2011) Effet de l’hétérogénéité paysagère sur la diversité gamma : le cas des carabes. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille : 5 habitats échantillonnés : les bois, les prairies permanentes, les prairies temporaires, les cultures et les haies. Pour mesurer la diversité gamma, 2 réplicats de chaque habitat ont été choisis : 10 relevés par maille.Plusieurs sessions de piégeage ont eu lieu entre mai et septembre 2011. Protocole : 2 pièges Barber par point d’échantillonnage, 4 périodes d’échantillonnage pour les céréales d’hiver, 6 périodes d’échantillonnage pour les autres types d’habitat. Les périodes d’échantillonnage correspondent à une ouverture des pièges pendant 1 semaine. Les relevés ont été réalisés entre Mai et Septembre 2011 Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf : Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity as an ecological filter of species traits. Acta Oecologica, 56: 19-26.

!! A mettre à jour !! (Accès dataset et carto) "Relevés carabes dans une mosaïque de quelques parcelles cultivées et leurs bordures sur la zone atelier de Pleine Fougères" Objectif : étudier la dynamique spatiale et saisonnière des carabes au sein 6 parcelles cultivées et leurs bordures. Protocole : échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) par piégeage, avec 5 stations de piégeage par parcelle et 2 stations de piégeage par bordure de champs (2 pots par station) ; pièges ouverts en continu et relevés toutes les semaines pendant 17 semaines. Programme de financement : projet ANR BIODIVAGRIM Publication en cours de rédaction.

Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de plantes Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Alignier, A., Solé‐Senan, X. O., Robleño, I., Baraibar, B., Fahrig, L., Giralt, D., ... & Batáry, P. (2020). Configurational crop heterogeneity increases within‐field plant diversity. Journal of Applied Ecology, 57(4), 654-663. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

Quantification de la connectivité paysagère par test de repasse sur les passereaux communs de la métropole rennaise. Identification des espèces et réponse à la repasse de chant territorial. Dans le cadre de la thèse de Manon Balbi, projet Corbam.

!! A mettre à jour !! (Accès jeu de données) "Relevés de flore en cultures annuelles en agriculture biologique et conventionnelle (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier la flore au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - Dix quadrats de 50 * 50 cm, positionnés tous les 3 mètres sur une bande située à 50m de la bordure de la parcelle (cf. schéma ci-dessous). Pour chacun noter : - le % de recouvrement pour : adventices total, graminées, dicotylédones, espèce dominante, espèces en montaison (attention graminées, fleurs discrètes) - le nombre d’espèces total, graminées, dicotylédones. Ces suivis ont été effectués en 2014, 2015, 2018, 2021 et 2023 Programmes de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO; projet PREPARE; projet STABIREG http://sebiopag.inrae.fr/