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"Relevés de la structure des bordures des champs sur les 3 mini-réseaux (A, B et C) de la ZAAr, 2015" Relevés de la structure des bordures de champs sur les 3 mini-réseaux (site A, B et C) de la Zone Atelier Armorique. Les variables mesurées sont la largeur de la bordure, la longueur de la bordure, la présence ou non de talus, la hauteur de talus, la présence ou non de fossé, la profondeur du fossé, la présence ou non de clôture, la localisation de la clôture. En parallèle, sur un échantillon de bordure, c'est-à-dire sur un tronçon de 25m de long représentatif de la physionomie générale de la bordure: 1) caractérisation de la structure verticale de la bordure: observation de la présence ou non de strate arbustive (si oui, évaluation en % de l'échantillon de bordure), présence ou non de strate arborée (si oui, évaluation en % de la longueur de l'échantillon de bordure + mesure de la hauteur dominante de la canopée + mesure de la largeur de la canopée), 2) notation des espèces arbustives dominantes, notation des espèces arborées dominantes, 3) estimation du % sol nu, du % de litière, du % de rocher sur la longueur de l'échantillon de bordure. Valorisation: Alignier A. (2018) Changes in a field margin vegetation metacommunity over a 21-year interval and the impacts of structural condition and management. Agriculture, Ecosystems and Environment, 251, 1-10
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Relevés floristiques avec les méthodes des quadrats, au sein de 29 prairies: 27 prairies temporaires d'âge de 1 à 25 ans et 2 prairies permanentes. Les prairies ont été standardisées en termes de pratiques agricoles: même semis initial et pâturage + 1 fauche annuelle, Les relevés ont consisté en 10 quadrats de 1 m² répartis sur la prairie, au sein desquels on a estimé les pourcentages de recouvrement de toutes les espèces végétales. Ce travail a été utilisé dans le but préalable de connaître l'évolution de la composition des communautés végétales prairiales au cours du temps, et utilisé dans le cadre de la thèse de Lou Barbe (chapitre 3) intitulée: "Conséquences de l'assemblage des communautés végétales sur la décomposition de leur litière".
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Suivi de carabes dans les haies (Pleine-Fougères, secteur A, 2007-...) - Zone Atelier Armorique ZAAr
"Suivi des communautés de carabes des haies du mini réseau A, ZAAr (2007-)" Ce suivi s'inscrit dans le suivi des communauté de carabes des haies des mini-réseaux de la Zone Atelier Armorique (site de Pleine-fougères). Dans le mini-réseau B, 10 haies ont été choisies en fonction de leur structure (strate arborescente, strate arbustive, talus, fossé...). Dans chaque haie sont positionnés 3 pot-barbers écartés de 1 à 2 m de distance. Ces pots-pièges sont positionnés au milieu de la haie. Pour chaque année d'étude, les pièges sont ouverts en continu, de fin avril à début octobre, par session de 15 jours. Ce suivi est effectué tous les 2 ans: 2007, 2009, 2011, 2013, 2015, 2017, 2019.
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Comprendre la réponse des communautés d’oiseaux à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : Protocole : Le plan d’échantillonnage de la communauté d’oiseaux nicheurs a été basé sur la méthode STOC-EPS (Suivi Temporel des Oiseaux Communs par Echantillonnages Ponctuels Simples). Cet échantillonnage prévoit trois passages afin de couvrir la phénologie des oiseaux forestiers : un passage début avril pour capter les nicheurs précoces et deux passages en mai et juin pour les nicheurs tardifs et espèces migratrices. L’échantillonnage consiste en la réalisation de points d’écoute : afin d’optimiser les contacts, l’observateur écoute les chants et cris d’oiseaux pendant 5 minutes en étant placé au centre de la zone étudiée, ici du bois. L’objectif étant d’être le plus exhaustif possible, 5 minutes d’écoute ont été rajoutées afin d’augmenter les chances d’entendre l’ensemble des espèces présentes. L’étude étant focalisée sur les espèces forestières, seuls les individus nichant dans les bois ont été retenus. Les relevés ont été réalisés entre Avril et Juin 2012 Article de référence : Gil Tena,A., Lecerf, R., Ernoult A. (2013). Disentangling community assemblages to depict an indicator of biological connectivity: a regional study of fragmented semi-natural grasslands. Ecological Indicators, 24: 48-55. Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.
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Classification obtenue à partir d'une image LANDSAT datée du 25-05-2014 dans le cadre du projet SERIPAGE
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Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".
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Objectif : Ce suivi a pour objectif d'analyser la dynamique végétale après semis des bandes enherbées expérimentales. Le semis a été réalisé en 2010 Sur les BE, les relevés floristiques ont été effectués en juin 2010, 3 mois après semis. Les quadrats utilisés sont de 2x2 m, positionnés à 3m du bord de la bande enherbée selon 10 points dans le sens de la longueur. Le pourcentage de recouvrement par rapport au sol des différentes espèces en présence a été évalué à l'estime avec une précision de 5%. Projet : ANR MODECOL Programme de recherche : Système Complexe et Modèlisation de l'ANR Coordinatrice : Cendrine Mony
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Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de pollinisation Protocole : Dépôt de plants de radis en fleurs en bordure de parcelle, laissés libres à la pollinisation ou non, puis récolte et pesage des graines Article de référence : Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in Western Europe, Annika L. Hass, Urs G. Kormann, Teja Tscharntke, Yann Clough, Aliette Bosem Baillod, Clélia Sirami, Lenore Fahrig, Jean-Louis Martin, Jacques Baudry, Colette Bertrand, Jordi Bosch, Lluís Brotons, Françoise Burel, Romain Georges, David Giralt, María Á. Marcos-García, Antonio Ricarte, Gavin Siriwardena and Péter Batáry. Proceedings of the Royal Society London B, 14 février 2018. DOI : 10.1098/rspb.2017.2242 Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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!! A mettre à jour !! (Accès au dataset et à la carto) "Diversité gamma des carabes (Nord Ille et Vilaine, 2011) Zone Atelier Armorique ZAAr" Caractérisation de la diversité gamma des carabes du Nord de l’Ille et Vilaine (2011) Effet de l’hétérogénéité paysagère sur la diversité gamma : le cas des carabes. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille : 5 habitats échantillonnés : les bois, les prairies permanentes, les prairies temporaires, les cultures et les haies. Pour mesurer la diversité gamma, 2 réplicats de chaque habitat ont été choisis : 10 relevés par maille.Plusieurs sessions de piégeage ont eu lieu entre mai et septembre 2011. Protocole : 2 pièges Barber par point d’échantillonnage, 4 périodes d’échantillonnage pour les céréales d’hiver, 6 périodes d’échantillonnage pour les autres types d’habitat. Les périodes d’échantillonnage correspondent à une ouverture des pièges pendant 1 semaine. Les relevés ont été réalisés entre Mai et Septembre 2011 Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf : Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity as an ecological filter of species traits. Acta Oecologica, 56: 19-26.
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Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)
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