Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de plantes Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Alignier, A., Solé‐Senan, X. O., Robleño, I., Baraibar, B., Fahrig, L., Giralt, D., ... & Batáry, P. (2020). Configurational crop heterogeneity increases within‐field plant diversity. Journal of Applied Ecology, 57(4), 654-663. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Objectif : Cette tâche vise à étudier la dynamique de la végétation après exclusion de la pression de pâturage. Un exclos au sein de chaque communauté a été mis en place en 2007 pour les communautés mésophile, mésohygrophile et hygrophile et en 2011 dan la prairie à glycérie. Un exclos sera également mis en place en 2011 dans le prolongement de la rosière du secteur Nord pour permettre une extension de sa surface. Programme de recherche : Convention d'étude avec la communauté des communes de la baie du Mont St-Michel Coordinatrice : Cendrine Mony

!! A mettre à jour !! (Accès dataset) "Relevés de carabes aux interfaces entre parcelles cultivées et leurs bordures (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" Objectif : étudier les flux et l'activité-densité associée des carabes entre cultures de différente nature (céréales d'hiver et maïs) et avec leurs bordures (haies), réparties dans 15 interfaces de cultures au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles et leurs bordures par piégeage, avec 2 stations de piégeage par parcelle et 2 stations de piégeage par bordure de champs (2 pots par station) ; échantillonnage des flux de carabes aux interfaces entre parcelles et entre parcelles et leurs bordures avec des pièges à interception (4 pots par piège à interception) ; pièges ouverts en continu et relevés toutes les 2 semaines pendant 8 semaines au printemps et pendant 4 semaines à l'automne. Programme de financement : projet DIVA AGRICONNECT Martel, G., Aviron, S., Joannon, A., Lalechère, E., Roche, B., & Boussard, H. (2017). Impact of farming systems on agricultural landscapes and biodiversity: From plot to farm and landscape scales. European Journal of Agronomy.

Objectif: Impact de l'urbanisation des terres sur les communautés de coléoptères carabidés de boisements. Méthodes: Échantillonnage des communautés (mai-juillet) de coléoptères carabidés dans 19 sites répartis le long d’un gradient rural-urbain (Rennes et sa périphérie). Série temporelle pour les coléoptères.

Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.

Suivi temporel de la diversité et de l’abondance des communautés de petits mammifères sur les réseaux de haies du bocage et des digues plantées de la zone des polders . 24 haies (16 en bocage, 8 en polders). 7 sessions de piégeage : Avril, mai, juin, aout, sept, oct 2003 et Fev 2004 Méthode : line transect : 34 pièges INRA appâtés espacés tous les 3 mètres sur un transect de 100 mètres. Relevés à 24 et 48 heures Articles de références : -Michel, N., Burel, F. and Butet, A. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes ? Acta oecologica, 30 : 11-20 -Michel, N., Burel, F., Legendre, P. & Butet, A. 2007. Role of habitat and landscape in structuring small mammal assemblages in hedgerow networks of contrasted farming landscapes in Brittany, France. Landscape Ecology, 22 : 1241-1253. Pas de programme particulier

Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de pollinisation Protocole : Dépôt de plants de radis en fleurs en bordure de parcelle, laissés libres à la pollinisation ou non, puis récolte et pesage des graines Article de référence : Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in Western Europe, Annika L. Hass, Urs G. Kormann, Teja Tscharntke, Yann Clough, Aliette Bosem Baillod, Clélia Sirami, Lenore Fahrig, Jean-Louis Martin, Jacques Baudry, Colette Bertrand, Jordi Bosch, Lluís Brotons, Françoise Burel, Romain Georges, David Giralt, María Á. Marcos-García, Antonio Ricarte, Gavin Siriwardena and Péter Batáry. Proceedings of the Royal Society London B, 14 février 2018. DOI : 10.1098/rspb.2017.2242 Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

Comprendre la réponse des communautés d’oiseaux à la connectivité du paysage. 25 bois échantillonnés : Protocole : Le plan d’échantillonnage de la communauté d’oiseaux nicheurs a été basé sur la méthode STOC-EPS (Suivi Temporel des Oiseaux Communs par Echantillonnages Ponctuels Simples). Cet échantillonnage prévoit trois passages afin de couvrir la phénologie des oiseaux forestiers : un passage début avril pour capter les nicheurs précoces et deux passages en mai et juin pour les nicheurs tardifs et espèces migratrices. L’échantillonnage consiste en la réalisation de points d’écoute : afin d’optimiser les contacts, l’observateur écoute les chants et cris d’oiseaux pendant 5 minutes en étant placé au centre de la zone étudiée, ici du bois. L’objectif étant d’être le plus exhaustif possible, 5 minutes d’écoute ont été rajoutées afin d’augmenter les chances d’entendre l’ensemble des espèces présentes. L’étude étant focalisée sur les espèces forestières, seuls les individus nichant dans les bois ont été retenus. Les relevés ont été réalisés entre Avril et Juin 2012 Article de référence : Gil Tena,A., Lecerf, R., Ernoult A. (2013). Disentangling community assemblages to depict an indicator of biological connectivity: a regional study of fragmented semi-natural grasslands. Ecological Indicators, 24: 48-55. Projet Agriconnect (2011-2015) : Continuités écologiques dans les paysages agricoles. Projet financé par le ministère chargé de l’écologie dans le cadre du programme DIVA.