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Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.
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Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".
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"Relevés floristiques des prairies de fonds de vallée de 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune, 2017" Protocole: La méthode consiste en un échantillonnage exhaustif de la végétation vasculaire des parcelles de prairies de fond de vallée, au niveau de 20 quadrats de 1m² (1m x 1m) disposés de part et d'autre de 5 transects équidistants (transversaux par rapport au cours d'eau). Dix quadrats sont positionnés de part et d'autre de chacun de ces transects à 1m du bord de la parcelle (côté Sélune) , on les appellera "quadrats de bord". Les dix autres sont également positionnés de part et d'autre de chacun des transects, mais à une distance à la bordure égale à la moitié de la longueur des transects. On les appellera "quadrats de centre". A chaque espèce identifiée est attribué un coefficient d'abondance-dominance d'après l'échelle de Braun Blanquet. Projet de recherche: Seripage Site du projet: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE
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Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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!! A mettre à jour !! (Accès carto + dataset) Analyse des effets du contexte paysager et des parcelles adjacentes sur les communautés de coléoptères carabiques des haies, dans trois paysages bocagers de structure contrastée. Protocole : piégeage d’insectes par pots barber Une publication : Aviron, S., F. Burel, et al. (2005). "Carabid assemblages in agricultural landscapes: impacts of habitat features, landscape context at different spatial scales and farming intensity." Agriculture Ecosystems and Environment108(3): 205-217. Effectué dans le cadre du projet DIVA ('Diva 1') Financé par le ministère de l'écologie
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Importance des bandes enherbées dans le fonctionnement de la communauté des syrphes entomophages en sein des paysages agricoles Protocole : 10 couples de parcelles de blé échantillonnées : 10 avec présence de BE et 10 sans BE. Pour les 20 parcelles : 3 pièges jaune par parcelle à 20m de la bordure. Pièges distants de 10m Pour les 9 BE : 2 pièges jaunes espacés de 10m. Suivis de mi avril à mi juillet 2008 Article de référence : Ernoult A, Vialatte A, Butet A, Michel N, Rantier Y, Jambon O, Burel F (2013). Grassy strips in their landscape context, their role as new habitat for biodiversity, Agriculture, Ecosystems & Environment, 166: 15-27 Programme interdisciplinaire CNRS CEMAGREF Ingénierie Écologique
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Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de contrôle biologique des ravageurs de culture Protocole : Installation de cartes sur lesquelles des pucerons sont offerts à la prédation le long de 2 transects en centre de parcelle puis comptage du nombre de pucerons prédatés après 24h Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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!! A mettre à jour !! (Accès dataset + affichage carto) Objectif : étudier la diversité spécifique et l'activité-densité des prédateurs (carabes) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage des espèces et de leurs abondances (ou activités-densités) dans les parcelles, avec 4 stations de piégeage par parcelle (2 pots par station); pièges ouverts pendant 4 jours à 2 périodes (mai et juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inra.fr/
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Conséquences de l’intensification agricole sur l’abondance de deux rapaces diurnes : la buse variable (Buteo buteo) et le faucon crécerelle (Falco tinnunculus) (Depuis 2004): Suivi par méthode IPA et IKA de l’abondance de deux espèces de rapaces diurnes dans 3 contextes paysagers contrastés ZAA et polders de la Baie du Mont st Michel Suivi IPA-IKA permanent tous les deux mois depuis décembre 2004 (suivi mensuel au cours de l’année 2005) Article de référence : -Butet, A., Michel, N., Rantier Y., Comor, V., Hubert-Moy, L., Nabucet, J., Delettre, Y. 2010. Responses of Common Buzzard (Buteo buteo) and Eurasian Kestrel (Falco tinnunculus) to land use changes in agricultural landscapes of Western France. Agriculture, Ecosystems and Environment, 138: 152-159. Programme : Programme national ANR-ECCO (CNRS INSU) « Dynamique des paysages et interactions proies-prédateurs (petits mammifères, rapaces). Conséquences de l’intensification agricole sur l’architecture des réseaux trophiques et les transferts de biomasse.
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Ce suivi a pour but d’analyser l’impact des facteurs abiotiques et de gestion agricole sur la structuration des communautés végétales de prairies humides. Protocole utilisé : 11 mailles paysagères de 500m de coté situées le long de la basse vallée du Couesnon. Au sein de la maille, choix de trois parcelles par mode de gestion (paturage, fauche, mixte). A l’intérieur de la parcelle, une zone tampon de 10m au sein de la parcelle est réalisée. Tous les habitats ont été échantillonnés au moins une fois, le nombre de relevés dépendant de leur abondance respective au sein de la parcelle. Un seul seul relevé en 2012. Les relevés floristiques sont réalisées selon la méthode de Braun-Blanquet