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  • Classification obtenue à partir d'une image LANDSAT datée du 25-05-2014 dans le cadre du projet SERIPAGE

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    Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

  • Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".

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    Communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) Protocole : Echantillonnage par coupelles colorées (Pan Traps) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Hass, A. L., Kormann, U. G., Tscharntke, T., Clough, Y., Baillod, A. B., Sirami, C., ... & Batáry, P. (2018). Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in western Europe. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 285(1872), 20172242. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) Objectif : étudier l'intensité de la prédation de proies sentinelles (pucerons, graines d'adventices et oeufs) au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : - échantillonnage de la prédation par exposition de cartes contenant des proies sentinelles (3 pucerons, ou 10 graines d'adventices ou un paquet d'oeufs d'insectes), les cartes étant installés en 10 points répartis sur 2 transects parallèles (transects à 15m de la bordure de parcelle, 10m entre transects, 12m entre points) ; exposition des cartes pendant 24h pour les pucerons et 4 jours pour les graines et les œufs, à 2 périodes (début mai, début juin). Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inrae.fr/ Suivis réalisés en 2014, 2015, 2016, 2018, 2021 et 2023

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    !! A mettre à jour !! (Accès dataset) Objectif : étudier la hauteur du couvert au sein de parcelles de céréales d'hiver en agriculture biologique et conventionnelle, réparties dans 20 paysages au sud de l'Ille et Vilaine. Protocole : mesurer la hauteur du couvert dans 4 stations de piégeages de chaque parcelle. Programme de financement : projet SEBIOPAG-ECOPHYTO http://sebiopag.inrae.fr/

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    Ce suivi a pour but d’analyser l’impact des facteurs abiotiques et de gestion agricole sur la structuration des communautés végétales de prairies humides. Protocole utilisé : 11 mailles paysagères de 500m de coté situées le long de la basse vallée du Couesnon. Au sein de la maille, choix de trois parcelles par mode de gestion (paturage, fauche, mixte). A l’intérieur de la parcelle, une zone tampon de 10m au sein de la parcelle est réalisée. Tous les habitats ont été échantillonnés au moins une fois, le nombre de relevés dépendant de leur abondance respective au sein de la parcelle. Un seul seul relevé en 2012. Les relevés floristiques sont réalisées selon la méthode de Braun-Blanquet

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    Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

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    Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de contrôle biologique des ravageurs de culture Protocole : Installation de cartes sur lesquelles des pucerons sont offerts à la prédation le long de 2 transects en centre de parcelle puis comptage du nombre de pucerons prédatés après 24h Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

  • Effets de l’évolution des paysages agricoles sur les communautés de carabes et de petits mammifères (1998-1999): Etude de la diversité et de l’abondance des communautés de petits mammifères et de carabes dans 11 contextes paysagers en Bretagne. Carabes échantillonnés de mai à juillet 1998. Les collectes ont été réalisées sur 11 sites de 1km2, 10 haies avec 3 pot-pièges dans chaque haie. Petits mammifères : Etude indirecte par analyse de pelotes de rapaces. 4 sessions de collecte de pelotes d’effraie de sept 1998 à Oct 1999. Articles de références : -Millán-Peña, N., Butet A., Delettre, Y., Morant, P. & Burel, F. 2003. Landscape context and carabid beetles (Coleoptera: Carabidae) communities of hedgerows in western France. Agriculture, Ecosystems and Environments, 94 : 59-72. -Millán-Peña, N. , Butet, A., Delettre, Y., Paillat, G., Morant, P., Le Du, L. and F. Burel. 2003. Response of the small mammal community to changes in western French agricultural landscapes. Landscape Ecology, 18 : 265 - 278. -Burel, F., Butet, A. Delettre, Y.R. and Millàn de la Peña, N. 2004. Differential response of selected taxa to landscape context and agricultural intensification. Landscape and Urban Planning, 67 : 195 - 204. Programme de recherche : Le Du, L., Morant, P., Burel, F. Butet, A.., Millan, N., Rantier Y. Wolff, A., Rozé, F. Saliou, P. Baudry, J. Volant, D. 2000. Cartographie et évaluation de la qualité biologique du bocage du département des côtes d’Armor. Plan départemental pour l’Environnement Action 15-1 Amélioration des connaissances du bocage 2 volumes, 200 p. (RAPPORT)