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Un barrage bloque le passage de nombreuses espèces de poissons migrateurs, mais certaines pas totalement. L’effet de fragmentation sur la diversité génétique des espèces qui en résulte va dépendre de l’ancienneté du barrage et de la taille efficace de la population de l’espèce considérée. Pour quantifier cet effet de manière standardisée, un nouvel indice de différenciation génétique, nommé 'F Index' pour 'Fragmentation index' a été récemment proposé (Prunier et al., 2020). Ce 'F Index' va être calculé pour 5 espèces de poissons (goujon, vairon, chevesne, chabot et loche franche) échantillonnées sur la Sélune en amont et en aval des barrages de Vezins et La Roche-qui-Boit, et ce avant et après l’effacement des barrages. Les résultats devraient aider à mesurer l’effet de restauration de la connectivité entre populations, la vitesse de cet effet, et aussi de le comparer entre espèces. Cette couche donne la localisation des secteurs d'étude utilisés dans le cadre du projet de recherche "Mesure de la restauration de la connectivité entre populations de poissons suite à l’arasement des barrages de la Sélune", dit "F Index".
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"155 outils et méthodes d'observation de la biodiversité: base de données excel et résumé des fonctions de chaque outil (2017)" Cette base de données à été crée en 2017 par Ninon Chauvy lors de son stage de Licence Professionnelle intitulé "Outils et méthodes d'évaluation de la biodiversité à l'échelle de l'exploitation". Le stage de Ninon Chauvy a été encadré par Audrey Alignier (audrey.alignier@inra.fr) et Bénédicte Roche (benedicte.roche@inrae.fr) de l'UMR INRAE 0980 BAGAP. Le stage avait pour objectif de faire un état des lieux des outils et méthodes d'observaiton de la biodiversité. Ce stage s'inscrit dans le cadre du projet PEI-Agri 2017 "Favoriser l'autonomie des agriculteurs dans l'évaluation de la biodiversité sur leur exploitation".Ce projet est porté conjointement par la FRCIVAM (Hélène Roisille), Bretagne Vivante (Luc Guihard) et l'INRAE UMR 0980 BAGAP (Audrey Alignier et Bénédicte Roche).Ce projet a été soutenu par le Fonds européen agricole pour le développement rural – FEADER
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Classification obtenue à partir d'une image LANDSAT datée du 25-05-2014 dans le cadre du projet SERIPAGE
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"Relevés floristiques en bordures de champs suivant un référentiel de 31 espèces dans 9 paysages agricoles distribués le long du fleuve Sélune, 2016" Relevés floristiques suivant un référentiel de 31 espèces (espèces du référentiel Ecobordure) sur une vingtaine de bordures de champs dans 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune. Projet de recherche: Seripage Site du projet de recherche: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE
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"Relevés floristiques des prairies de fonds de vallée de 9 paysages agricoles de 1km² distribués le long du fleuve Sélune, 2017" Protocole: La méthode consiste en un échantillonnage exhaustif de la végétation vasculaire des parcelles de prairies de fond de vallée, au niveau de 20 quadrats de 1m² (1m x 1m) disposés de part et d'autre de 5 transects équidistants (transversaux par rapport au cours d'eau). Dix quadrats sont positionnés de part et d'autre de chacun de ces transects à 1m du bord de la parcelle (côté Sélune) , on les appellera "quadrats de bord". Les dix autres sont également positionnés de part et d'autre de chacun des transects, mais à une distance à la bordure égale à la moitié de la longueur des transects. On les appellera "quadrats de centre". A chaque espèce identifiée est attribué un coefficient d'abondance-dominance d'après l'échelle de Braun Blanquet. Projet de recherche: Seripage Site du projet: https://www6.rennes.inrae.fr/bagap/RECHERCHE/Analyse-et-modelisation-du-paysage/Projets-termines/SERIPAGE
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Code and data to replicate the results in the paper Mating system and the evolution of recombination rates in seed plants. This publication is a meta-analysis gathering data on genetic maps and life history traits in more than one hundred plant species.
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Effets de l’évolution des paysages agricoles sur les communautés de carabes et de petits mammifères (1998-1999): Etude de la diversité et de l’abondance des communautés de petits mammifères et de carabes dans 11 contextes paysagers en Bretagne. Carabes échantillonnés de mai à juillet 1998. Les collectes ont été réalisées sur 11 sites de 1km2, 10 haies avec 3 pot-pièges dans chaque haie. Petits mammifères : Etude indirecte par analyse de pelotes de rapaces. 4 sessions de collecte de pelotes d’effraie de sept 1998 à Oct 1999. Articles de références : -Millán-Peña, N., Butet A., Delettre, Y., Morant, P. & Burel, F. 2003. Landscape context and carabid beetles (Coleoptera: Carabidae) communities of hedgerows in western France. Agriculture, Ecosystems and Environments, 94 : 59-72. -Millán-Peña, N. , Butet, A., Delettre, Y., Paillat, G., Morant, P., Le Du, L. and F. Burel. 2003. Response of the small mammal community to changes in western French agricultural landscapes. Landscape Ecology, 18 : 265 - 278. -Burel, F., Butet, A. Delettre, Y.R. and Millàn de la Peña, N. 2004. Differential response of selected taxa to landscape context and agricultural intensification. Landscape and Urban Planning, 67 : 195 - 204. Programme de recherche : Le Du, L., Morant, P., Burel, F. Butet, A.., Millan, N., Rantier Y. Wolff, A., Rozé, F. Saliou, P. Baudry, J. Volant, D. 2000. Cartographie et évaluation de la qualité biologique du bocage du département des côtes d’Armor. Plan départemental pour l’Environnement Action 15-1 Amélioration des connaissances du bocage 2 volumes, 200 p. (RAPPORT)
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Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de pollinisation Protocole : Dépôt de plants de radis en fleurs en bordure de parcelle, laissés libres à la pollinisation ou non, puis récolte et pesage des graines Article de référence : Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in Western Europe, Annika L. Hass, Urs G. Kormann, Teja Tscharntke, Yann Clough, Aliette Bosem Baillod, Clélia Sirami, Lenore Fahrig, Jean-Louis Martin, Jacques Baudry, Colette Bertrand, Jordi Bosch, Lluís Brotons, Françoise Burel, Romain Georges, David Giralt, María Á. Marcos-García, Antonio Ricarte, Gavin Siriwardena and Péter Batáry. Proceedings of the Royal Society London B, 14 février 2018. DOI : 10.1098/rspb.2017.2242 Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland
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Relevés floristiques avec les méthodes des quadrats, au sein de 29 prairies: 27 prairies temporaires d'âge de 1 à 25 ans et 2 prairies permanentes. Les prairies ont été standardisées en termes de pratiques agricoles: même semis initial et pâturage + 1 fauche annuelle, Les relevés ont consisté en 10 quadrats de 1 m² répartis sur la prairie, au sein desquels on a estimé les pourcentages de recouvrement de toutes les espèces végétales. Ce travail a été utilisé dans le but préalable de connaître l'évolution de la composition des communautés végétales prairiales au cours du temps, et utilisé dans le cadre de la thèse de Lou Barbe (chapitre 3) intitulée: "Conséquences de l'assemblage des communautés végétales sur la décomposition de leur litière".
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"Relevés de la structure des bordures des champs sur les 3 mini-réseaux (A, B et C) de la ZAAr, 2015" Relevés de la structure des bordures de champs sur les 3 mini-réseaux (site A, B et C) de la Zone Atelier Armorique. Les variables mesurées sont la largeur de la bordure, la longueur de la bordure, la présence ou non de talus, la hauteur de talus, la présence ou non de fossé, la profondeur du fossé, la présence ou non de clôture, la localisation de la clôture. En parallèle, sur un échantillon de bordure, c'est-à-dire sur un tronçon de 25m de long représentatif de la physionomie générale de la bordure: 1) caractérisation de la structure verticale de la bordure: observation de la présence ou non de strate arbustive (si oui, évaluation en % de l'échantillon de bordure), présence ou non de strate arborée (si oui, évaluation en % de la longueur de l'échantillon de bordure + mesure de la hauteur dominante de la canopée + mesure de la largeur de la canopée), 2) notation des espèces arbustives dominantes, notation des espèces arborées dominantes, 3) estimation du % sol nu, du % de litière, du % de rocher sur la longueur de l'échantillon de bordure. Valorisation: Alignier A. (2018) Changes in a field margin vegetation metacommunity over a 21-year interval and the impacts of structural condition and management. Agriculture, Ecosystems and Environment, 251, 1-10
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